More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4965 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  73.23 
 
 
255 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  62.4 
 
 
255 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  60.8 
 
 
255 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  56.28 
 
 
259 aa  291  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  54.15 
 
 
257 aa  288  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  56.92 
 
 
260 aa  278  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  57.09 
 
 
256 aa  268  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  40.71 
 
 
247 aa  164  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  41.8 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  40.82 
 
 
239 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  40.82 
 
 
239 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  41.77 
 
 
242 aa  158  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  40.65 
 
 
239 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  38.98 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 
254 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  39.68 
 
 
256 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  41.13 
 
 
275 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  37.6 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  42.01 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  48.3 
 
 
271 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  44.81 
 
 
259 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
252 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
256 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  45.96 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  38.97 
 
 
270 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  35.18 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  37.75 
 
 
251 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  37.09 
 
 
251 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  37.09 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  37.93 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  37.09 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  37.09 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  25.25 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  36.78 
 
 
252 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  33.76 
 
 
254 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  38.62 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.63 
 
 
308 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  38.99 
 
 
249 aa  102  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  32.79 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  40.3 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  49.66 
 
 
280 aa  92  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.06 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
276 aa  85.1  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  34.5 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03990  expressed protein  26.09 
 
 
364 aa  82  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  40.88 
 
 
284 aa  82  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  38.62 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  36.31 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  44.66 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  40.48 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
267 aa  75.1  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  32.07 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  44.17 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  30.21 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  38.35 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  41.04 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  39.04 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  40.71 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  40 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  40.3 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  38.1 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  38.67 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  40.3 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  29.34 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  37.3 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  42.15 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  36.22 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  39.06 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  42.27 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.33 
 
 
213 aa  67  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  26.95 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  35.38 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  26.95 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  38.81 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.14 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  29.02 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  34.68 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4481  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980043  normal  0.396448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  32 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  35.46 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  35.46 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>