90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3647 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
384 aa  779    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  42.05 
 
 
386 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 
828 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
1476 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
740 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
740 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
1271 aa  106  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
1265 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
924 aa  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
953 aa  96.7  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
1303 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  25.87 
 
 
1147 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
673 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.64 
 
 
2401 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
1239 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
1301 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  31.85 
 
 
1608 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3909  hypothetical protein  29.05 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
1292 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5354  hypothetical protein  26.57 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  26.48 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
1220 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  34.68 
 
 
361 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  29.41 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  21.76 
 
 
331 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  25.74 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  25.95 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  31.55 
 
 
384 aa  62.8  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  35.4 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.6 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5347  hypothetical protein  27.02 
 
 
337 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  25.32 
 
 
1444 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
354 aa  59.7  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 
352 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  35.64 
 
 
364 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  32.23 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.87 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1916  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
383 aa  53.5  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
372 aa  53.5  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  31.52 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3298  hypothetical protein  27.48 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0661206  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
358 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 
385 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
370 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2617  hypothetical protein  29.7 
 
 
391 aa  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
371 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  30.73 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
1188 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
342 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
356 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
1187 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
1190 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
581 aa  46.6  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
1317 aa  47  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
368 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.14 
 
 
1191 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1400  hypothetical protein  28.48 
 
 
351 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  28.81 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.5 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
373 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
517 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5020  hypothetical protein  38.67 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
393 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
357 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
374 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7833  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
732 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
416 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.23 
 
 
388 aa  44.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3344  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 
445 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.23 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
1359 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
1213 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.81 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
370 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0801  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
388 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  36.67 
 
 
360 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
405 aa  43.5  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
428 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.88 
 
 
385 aa  43.1  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  32.5 
 
 
564 aa  43.1  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
371 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>