79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3344 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3344  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 445 aa  920    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1123  putative glycosyltransferase  46.15 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2554  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 		 417 aa  236  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4176  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 370 aa  57  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 		 328 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 		 744 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 386 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 374 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  30.15 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1997  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 		 359 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.723795  normal  0.0390531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1118  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.08 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.357165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 382 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 364 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 367 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 359 aa  46.6  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02227  hypothetical protein  25 
 
 		 358 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.86 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.68 
 
 		 371 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 339 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  30.67 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  29.46 
 
 		 346 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  37.8 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 890 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  26.92 
 
 		 1121 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 656 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  23.7 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 		 371 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 367 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3517  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 329 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 344 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 377 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  24.44 
 
 		 330 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 440 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.52 
 
 		 373 aa  44.3  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 		 392 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  26.59 
 
 		 822 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 		 384 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  26.25 
 
 		 340 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 		 388 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 		 371 aa  43.9  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 371 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 		 401 aa  43.5  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  25.33 
 
 		 347 aa  43.1  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.39 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 360 aa  43.1  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 377 aa  43.1  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  41.54 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 401 aa  43.1  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 		 385 aa  43.1  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>