36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1123 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1123  putative glycosyltransferase  100 
 
 		 440 aa  917    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3344  glycosyl transferase, group 1  46.15 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2554  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4176  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 408 aa  53.5  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 364 aa  50.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 392 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 		 361 aa  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 		 405 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 390 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  21.11 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.24 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  25 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  28.66 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.15 
 
 		 371 aa  43.1  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1997  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 359 aa  43.1  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.723795  normal  0.0390531 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4575  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 		 413 aa  43.1  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161634  normal  0.819576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>