61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2554 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2554  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 417 aa  868    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3344  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 		 445 aa  236  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1123  putative glycosyltransferase  33.8 
 
 		 440 aa  223  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4176  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 353 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 772 aa  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2121  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.430294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  21.77 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1118  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.15 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.357165  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  20.98 
 
 		 393 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 810 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  28.72 
 
 		 803 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0778  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 333 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0355299  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 820 aa  50.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  22.12 
 
 		 385 aa  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0457  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.217311  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  28.49 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02227  hypothetical protein  27.74 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1228  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 330 aa  46.6  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000548043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 		 812 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 384 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  22.52 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  22.52 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  22.52 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1122  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 328 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  25 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3517  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003534  glycosyltransferase  25 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  25.15 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 386 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  23.49 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  27.07 
 
 		 401 aa  43.5  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3299  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 422 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 376 aa  43.1  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  23.49 
 
 		 378 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  26.78 
 
 		 373 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>