More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1621 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1621  capsular synthesis response regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 219 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  38.61 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  38.12 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  38.12 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  38.61 
 
 		 220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  36.84 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  36.97 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  40.62 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 246 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.99 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  40.89 
 
 		 265 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  33.5 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3986  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.039666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  35.07 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6653  two component LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879715  hitchhiker  0.00000102566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  36.11 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  36.11 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  36.28 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  34.16 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.96 
 
 		 232 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  34.16 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.96 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  35.35 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  35.35 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  35.35 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  35.35 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  35.35 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  35.35 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  35.35 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  35.35 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  35.35 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  35.35 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  35.35 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  35.35 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  36.49 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  32.84 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  36.49 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  32.84 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  34.88 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  34.88 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  34.88 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0880  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3667  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  33.5 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0293  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  33.5 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  33.5 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  33.17 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  35.96 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  34.1 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  33.5 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  33.5 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3543  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4824  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3743  two component LuxR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4728  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825096  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3504  DNA-binding transcriptional activator UhpA  35.47 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03553  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system wtih UhpB  36.45 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0034  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  36.45 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4178  DNA-binding transcriptional activator UhpA  36.45 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03495  hypothetical protein  36.45 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  36.45 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  35.15 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4250  DNA-binding transcriptional activator UhpA  36.45 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5099  DNA-binding transcriptional activator UhpA  36.45 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0828785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4205  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4034  DNA-binding transcriptional activator UhpA  36.45 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  35.64 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  35.64 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  33.17 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  35.64 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  35.64 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  35.64 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  35.64 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  35.64 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>