More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3543 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3543  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4824  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5459  two component LuxR family transcriptional regulator  97.33 
 
 		 225 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953036  normal  0.183697 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0880  two component LuxR family transcriptional regulator  87.56 
 
 		 232 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4728  two component LuxR family transcriptional regulator  76.44 
 
 		 225 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825096  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4205  two component LuxR family transcriptional regulator  76.7 
 
 		 225 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3779  two component LuxR family transcriptional regulator  69.63 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  55.2 
 
 		 225 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6659  two component LuxR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000389797  hitchhiker  0.000384101 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 220 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 220 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  39.44 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  36.02 
 
 		 214 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  36.15 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  36.15 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  36.28 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0030  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  33.95 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.56 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  36.67 
 
 		 214 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3939  two component transcriptional regulator  33.8 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3078  response regulator transcription regulator protein  34.27 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0498276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.3 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1021  putative response regulator  35.71 
 
 		 214 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  30.95 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  34.88 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3667  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  27.83 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3388  two-component response regulator transcription regulator protein  35.92 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0201761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  31.6 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  27.44 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  27.44 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  27.44 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  27.36 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  27.36 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3986  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.039666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  27.36 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  27.27 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.83 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  28.1 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  27.83 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  27.83 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  27.83 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  27.83 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  27.83 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  27.83 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  27.83 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  27.83 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  27.83 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  27.83 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  27.83 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0355  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  32.06 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  32.06 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  32.86 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  32.06 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  32.06 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  32.54 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  32.06 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  32.06 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  32.51 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  33.5 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4641  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.169112  normal  0.068024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0630  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.38 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.210211 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1157  two component LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  32.2 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4070  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.01 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.66 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4069  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0631  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.19 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.151672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0629  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0283  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.37 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393471  normal  0.0532877 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1621  capsular synthesis response regulator transcription regulator protein  33.17 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4071  two component LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>