More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0592 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  87.87 
 
 		 404 aa  739    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  833    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  88.42 
 
 		 406 aa  746    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  48 
 
 		 395 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  48.36 
 
 		 413 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  45.45 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  45.77 
 
 		 404 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  44.56 
 
 		 413 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  46.56 
 
 		 402 aa  354  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  44.94 
 
 		 402 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  45.09 
 
 		 409 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  46.06 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  44.95 
 
 		 410 aa  342  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  42.43 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  43.19 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  42.21 
 
 		 431 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  45.06 
 
 		 414 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  45.06 
 
 		 427 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  42.58 
 
 		 419 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  40.48 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 		 419 aa  316  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  40.95 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  41.71 
 
 		 395 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 		 372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  35.37 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  34.6 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 		 424 aa  229  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  33.58 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  35.05 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  32.18 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  31.66 
 
 		 392 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 		 398 aa  206  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 		 386 aa  205  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  35.01 
 
 		 436 aa  202  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  30.45 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 		 304 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  34.35 
 
 		 304 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  30.87 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  30.87 
 
 		 411 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  30.27 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  30 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 		 448 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  31.4 
 
 		 394 aa  192  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  28.31 
 
 		 403 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 396 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 		 405 aa  189  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 319 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  29.75 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30.69 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  31.81 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  30.37 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  27.09 
 
 		 417 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  30.38 
 
 		 389 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  30.03 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 		 391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  36.04 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  28.76 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  28.76 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  28.45 
 
 		 395 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 		 421 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  32.55 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  29.65 
 
 		 446 aa  159  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  31.95 
 
 		 350 aa  159  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  29.16 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  27.81 
 
 		 417 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  34.03 
 
 		 389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  26.93 
 
 		 417 aa  152  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  27.95 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>