111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0067 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  86.79 
 
 		 265 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  78.93 
 
 		 261 aa  397  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  79.45 
 
 		 261 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  77.19 
 
 		 257 aa  384  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  75.29 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  75.49 
 
 		 265 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  60.24 
 
 		 255 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  65.83 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  57.2 
 
 		 263 aa  279  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  56.57 
 
 		 647 aa  279  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  56 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  55.86 
 
 		 274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  56.03 
 
 		 277 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  59.77 
 
 		 252 aa  264  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  56.78 
 
 		 257 aa  264  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  58.26 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  58.26 
 
 		 283 aa  261  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  57.2 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  51.5 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  54.22 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  55.15 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  55.82 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  55.88 
 
 		 290 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  51.97 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  59.5 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  50.61 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  49.61 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  49.61 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  46.22 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  48.62 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  45.49 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  46.47 
 
 		 249 aa  201  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  50.88 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  43.48 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  45.19 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  47.95 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  36.65 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  43.46 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  35.12 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  33.2 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  35.15 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  32.86 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  32.86 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  24.06 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  26.6 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  27.59 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24.57 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  36.28 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  29.65 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.94 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  26.34 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  27.49 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  28.57 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.37 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  27.65 
 
 		 408 aa  52.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  38.81 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.51 
 
 		 368 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.6 
 
 		 370 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  31.25 
 
 		 409 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  34.07 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.33 
 
 		 368 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  32.12 
 
 		 402 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  25.68 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  32.35 
 
 		 406 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  26.58 
 
 		 397 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  29.23 
 
 		 406 aa  49.3  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  27.93 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 294 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.6 
 
 		 368 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.13 
 
 		 370 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  27.69 
 
 		 410 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.6 
 
 		 370 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  37.31 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  32.61 
 
 		 407 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.87 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  25.95 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  29.93 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  26.85 
 
 		 415 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3452  hypothetical protein  24.86 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281711  normal  0.0529388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  32.22 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  32.22 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  29.38 
 
 		 407 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  35.29 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.93 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  28.88 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  37.31 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  34.23 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.12 
 
 		 374 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  27.5 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 		 334 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>