More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3228 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  85.79 
 
 		 412 aa  720    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 401 aa  835    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 		 403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  42.86 
 
 		 403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.15 
 
 		 397 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2864  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 414 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2863  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  25.92 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  24.93 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 447 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 415 aa  99.8  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  27.27 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 424 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 391 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 409 aa  92.8  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  27.74 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 		 539 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  24.25 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 445 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 419 aa  90.1  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  23.91 
 
 		 778 aa  89.4  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 		 1303 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  26.54 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24 
 
 		 1867 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.54 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  29.71 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.44 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  30.58 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  25.12 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 		 782 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.06 
 
 		 462 aa  76.3  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.06 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  31.72 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1456  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>