49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1589 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  333  5e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  93.17 
 
 		 161 aa  314  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  86.18 
 
 		 158 aa  279  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  59.21 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  59.44 
 
 		 297 aa  184  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  58.04 
 
 		 278 aa  175  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  58.04 
 
 		 278 aa  175  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  54.42 
 
 		 148 aa  169  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  52.94 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  51.23 
 
 		 163 aa  160  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  51.39 
 
 		 178 aa  150  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  52.74 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  46.54 
 
 		 201 aa  144  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  45.33 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  56.6 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  44.37 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  45.39 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  40.97 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  41.22 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  46.36 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  32.3 
 
 		 161 aa  90.5  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  31.58 
 
 		 167 aa  85.1  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  34.64 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  34.9 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  31.76 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  30.12 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  31.72 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  34.29 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  28.29 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  48.08 
 
 		 211 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  43.4 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  47.27 
 
 		 117 aa  44.3  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  40.74 
 
 		 132 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  39.62 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  46 
 
 		 113 aa  43.9  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  41.51 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  30.91 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  41.51 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  48.98 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  47.17 
 
 		 119 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  53.19 
 
 		 239 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  34.69 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  47.06 
 
 		 132 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  40 
 
 		 119 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.86 
 
 		 517 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  46.94 
 
 		 206 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  48 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>