More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0692 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 311 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  97.75 
 
 		 311 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  79.6 
 
 		 299 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  72.58 
 
 		 310 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  74.16 
 
 		 298 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  65.55 
 
 		 300 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  64.88 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  64.55 
 
 		 300 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  59.66 
 
 		 303 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  61.41 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  62.21 
 
 		 307 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  65.55 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  65.55 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  60.48 
 
 		 309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  62.89 
 
 		 309 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  61.07 
 
 		 308 aa  341  9e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  61.02 
 
 		 313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  60.41 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  54.24 
 
 		 301 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  53.02 
 
 		 302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  52.51 
 
 		 302 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  50.99 
 
 		 305 aa  295  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  46.69 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  46.78 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  37.42 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  38.41 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  39.13 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  39.68 
 
 		 305 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  36.03 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  35 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  30.55 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  27.5 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  28.96 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  29.53 
 
 		 800 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  29.26 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  29.5 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  29.55 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  28.79 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  30.72 
 
 		 1215 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  32 
 
 		 818 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  29.56 
 
 		 1223 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  25.71 
 
 		 804 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  29.39 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.48 
 
 		 617 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  27.98 
 
 		 1228 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  28.03 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  27.18 
 
 		 807 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  25.78 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1406  homocysteine S-methyltransferase, putative  25 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  27.91 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  25.23 
 
 		 1212 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  28.12 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  32.25 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.18 
 
 		 605 aa  73.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1670  homocysteine S-methyltransferase family protein  25.34 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  27.99 
 
 		 804 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  29.9 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.81 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1894  B12-dependent methionine synthase  27.73 
 
 		 1229 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  28.75 
 
 		 813 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  25.16 
 
 		 1224 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  27.85 
 
 		 578 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  27.08 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  30.03 
 
 		 841 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  25 
 
 		 1286 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  26.76 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0167  homocysteine S-methyltransferase  26.87 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  27.51 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  28.98 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  24.61 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.83 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  25.23 
 
 		 1176 aa  69.3  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  26.74 
 
 		 351 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  23.94 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.63 
 
 		 1133 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  24.76 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.8 
 
 		 609 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.63 
 
 		 1132 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.71 
 
 		 1132 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25 
 
 		 1133 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  27 
 
 		 1132 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  25.3 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.21 
 
 		 616 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0266464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  27.49 
 
 		 1227 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.32 
 
 		 1132 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.32 
 
 		 1132 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  28.9 
 
 		 1184 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  25.9 
 
 		 629 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  26.47 
 
 		 1238 aa  67.4  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  26.69 
 
 		 841 aa  67  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  25.23 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  29.13 
 
 		 1249 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  28.12 
 
 		 803 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.09 
 
 		 1132 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  29.87 
 
 		 806 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  24.69 
 
 		 1227 aa  66.2  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  27.22 
 
 		 1266 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  25.23 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.44 
 
 		 615 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1980  methionine synthase  24.09 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>