More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2624 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  100 
 
 		 199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  81.91 
 
 		 199 aa  349  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  81.91 
 
 		 199 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  81.41 
 
 		 199 aa  346  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  67.2 
 
 		 208 aa  262  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  57.95 
 
 		 195 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  65.57 
 
 		 203 aa  252  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.44 
 
 		 205 aa  248  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.37 
 
 		 198 aa  247  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.03 
 
 		 196 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.03 
 
 		 196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.03 
 
 		 196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  60.51 
 
 		 196 aa  241  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  56.92 
 
 		 198 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  56.92 
 
 		 198 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  56.92 
 
 		 198 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  56.92 
 
 		 198 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  57.44 
 
 		 196 aa  240  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.29 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  56.92 
 
 		 196 aa  239  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  56.41 
 
 		 198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  58.85 
 
 		 200 aa  238  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.6 
 
 		 202 aa  238  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  57.44 
 
 		 196 aa  238  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  57.44 
 
 		 196 aa  238  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  56.92 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  56.41 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  56.92 
 
 		 196 aa  235  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  56.92 
 
 		 196 aa  235  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  56.92 
 
 		 196 aa  234  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  53.81 
 
 		 222 aa  223  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  52.17 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  49.73 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  46.49 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  46.45 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  50.59 
 
 		 176 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 		 171 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  50 
 
 		 175 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  44.1 
 
 		 175 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.25 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  41.21 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  37.58 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  41.76 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  42.86 
 
 		 174 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  42.26 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  40.35 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  42.26 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  37.65 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  39.02 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  38.6 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  38.82 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  37.82 
 
 		 173 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  36.47 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  38.95 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  40.25 
 
 		 172 aa  120  9e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  38.24 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.88 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2190  hypothetical protein  39.88 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0134235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  35.29 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  42.07 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  41.22 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  38.01 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  41.52 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  38.65 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  38.75 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.01 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  40.57 
 
 		 176 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  36.84 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  39.05 
 
 		 174 aa  118  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  35.88 
 
 		 174 aa  118  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  38.99 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  41.51 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  37.27 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  39.62 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  39.62 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  40.88 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  40.48 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  39.62 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  41.61 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  39.88 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  37.65 
 
 		 173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  38.36 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  39.16 
 
 		 188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  38.55 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  38.99 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 		 261 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  37.89 
 
 		 174 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0612  hexapaptide repeat-containing transferase  37.75 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  39.55 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  38.99 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  42.94 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  37.74 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  38.36 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  38.01 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  38.36 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  40.46 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1635  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.98 
 
 		 177 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0836  carbonic anhydrase  39.22 
 
 		 178 aa  115  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  38.04 
 
 		 173 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  34.71 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>