More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3187 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2642  GntR family transcriptional regulator  92.95 
 
 		 496 aa  867    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2148  GntR family transcriptional regulator  92.09 
 
 		 498 aa  858    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3187  transcriptional regulator  100 
 
 		 487 aa  999    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.685376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 521 aa  346  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7471  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 478 aa  306  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 499 aa  303  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 480 aa  300  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.37 
 
 		 508 aa  290  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.38 
 
 		 494 aa  286  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 492 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.55 
 
 		 473 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.38 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3547  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.73 
 
 		 477 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 485 aa  273  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.39 
 
 		 482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.22 
 
 		 487 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2755  putative transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 456 aa  262  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.243959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.63 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.2 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.73 
 
 		 489 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4437  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 469 aa  228  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  30.62 
 
 		 484 aa  219  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.03 
 
 		 485 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.32 
 
 		 485 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.32 
 
 		 488 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.16 
 
 		 488 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 504 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 503 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 509 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  32.85 
 
 		 493 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 494 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  33.06 
 
 		 570 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.5 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 494 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 494 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  33.68 
 
 		 493 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 490 aa  197  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 494 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 490 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 494 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  32.83 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 491 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 574 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.15 
 
 		 517 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  29.24 
 
 		 489 aa  190  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  31.26 
 
 		 478 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 547 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  31.17 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.78 
 
 		 501 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3680  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.22 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  29.89 
 
 		 508 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4374  putative transcriptional regulator, GntR family  30.31 
 
 		 508 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 473 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  30.42 
 
 		 503 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.44 
 
 		 504 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 509 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  29.46 
 
 		 509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4617  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.4 
 
 		 515 aa  181  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3752  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 513 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  31.24 
 
 		 470 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 490 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 490 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 498 aa  180  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 509 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 509 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  30.44 
 
 		 476 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0695  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0519778  hitchhiker  0.00612564 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  28.21 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 491 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 508 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1990  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 508 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 501 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 477 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  29.92 
 
 		 502 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 513 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 444 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 480 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.5 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.5 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>