More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2584 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
434 aa  881    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  59.84 
 
 
397 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  62.56 
 
 
409 aa  494  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  59.11 
 
 
393 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  58.07 
 
 
394 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.42 
 
 
383 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  54.92 
 
 
394 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  47.95 
 
 
397 aa  333  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  44.9 
 
 
417 aa  332  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  44.95 
 
 
405 aa  323  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  45.15 
 
 
405 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  47.03 
 
 
411 aa  305  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  26.37 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.38 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  28.06 
 
 
557 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.16 
 
 
404 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
445 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
411 aa  96.7  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
463 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
406 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  28.13 
 
 
569 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
348 aa  93.2  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
435 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
415 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
405 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
672 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
419 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  23.03 
 
 
401 aa  89.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
443 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
443 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
443 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
443 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
498 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
495 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
499 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
389 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
436 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
422 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
402 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
440 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
386 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  29.69 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  26.5 
 
 
458 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
400 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
419 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
405 aa  84  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
439 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
439 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.21 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
438 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  27.21 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  25.05 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  26.03 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
448 aa  79.7  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
369 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  26.1 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
393 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  27.03 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
415 aa  79  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
411 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
481 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  25.71 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  24.17 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 
387 aa  77  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.72 
 
 
536 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
904 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  23.06 
 
 
650 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>