250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1086 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 350 aa  708    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  77.31 
 
 		 357 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  76.86 
 
 		 348 aa  560  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  77.31 
 
 		 357 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  73.86 
 
 		 357 aa  536  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  67.14 
 
 		 352 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  67.33 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.11 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.9 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.86 
 
 		 345 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.17 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.86 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.69 
 
 		 348 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  32 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.76 
 
 		 345 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.3 
 
 		 357 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.29 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.5 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.95 
 
 		 344 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.9 
 
 		 351 aa  179  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.86 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.88 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.21 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.39 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  31.07 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.74 
 
 		 363 aa  172  5.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  30.77 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  30.47 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  30.47 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.84 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  30.77 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.33 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  30.47 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  30.47 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  30.77 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  30.09 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  30.77 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  30.35 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  30.47 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.06 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  30.2 
 
 		 343 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  30 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  31.09 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  30.53 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.23 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  31.7 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  30.53 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.74 
 
 		 340 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  30.92 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  31.41 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.35 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  30.73 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  31.92 
 
 		 351 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  30.64 
 
 		 339 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  30.97 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.94 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  30.25 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.37 
 
 		 340 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  31.38 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  31.41 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  31.56 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  31.29 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.8 
 
 		 351 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.78 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  32.52 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  30.43 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.94 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.8 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  30.72 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.76 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  30.9 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  29.57 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3244  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.67 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.31 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  30.43 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  30.43 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  30.14 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  29.71 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  30.43 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  30.43 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  30.43 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  30.43 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  30.43 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  29.39 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  30.43 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  30.72 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  31.21 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>