More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3483 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3483  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
385 aa  789    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0885784 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  27.11 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
408 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
379 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
403 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
381 aa  142  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
396 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  24.8 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
391 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
378 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1971  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
407 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.341888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
390 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
361 aa  96.3  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
377 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.67 
 
 
745 aa  94  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  26.14 
 
 
393 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
421 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
381 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.89 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
396 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
387 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
404 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
410 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
377 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  25.25 
 
 
598 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  24 
 
 
350 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  26.25 
 
 
370 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.04 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  23.46 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
408 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.66 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  27.66 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  27.66 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  27.66 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.66 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.66 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.26 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.66 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
424 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.51 
 
 
381 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
413 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  24.76 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  27.03 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.04 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  25.5 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
1079 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 
360 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.07 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
770 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  24.06 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  21.09 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>