123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0009 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01365  predicted hydrolase  57.89 
 
 		 585 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.693109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2235  conserved hypothetical protein  57.89 
 
 		 585 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01377  hypothetical protein  57.89 
 
 		 585 aa  667    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.748745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  81.03 
 
 		 585 aa  969    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4012  Alpha/beta hydrolase fold  67.59 
 
 		 591 aa  762    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4520  Alpha/beta hydrolase  65.46 
 
 		 589 aa  744    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0893  alpha/beta hydrolase fold  64.94 
 
 		 589 aa  739    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1253  alpha/beta hydrolase fold  65.46 
 
 		 599 aa  748    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31720  hypothetical protein  82.71 
 
 		 586 aa  954    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.137406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1375  alpha/beta hydrolase fold  64.94 
 
 		 589 aa  739    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0199502  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4659  alpha/beta hydrolase fold protein  71.13 
 
 		 590 aa  824    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0009  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 584 aa  1189    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2697  hypothetical protein  82.88 
 
 		 586 aa  954    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  57.9 
 
 		 594 aa  681    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3003  hypothetical protein  57.44 
 
 		 587 aa  675    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1173  alpha/beta hydrolase fold  55.4 
 
 		 578 aa  636    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000196015  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1493  hypothetical protein  58.06 
 
 		 585 aa  668    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1591  hypothetical protein  57.71 
 
 		 585 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1290  hypothetical protein  57.44 
 
 		 587 aa  675    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.620525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3081  alpha/beta hydrolase fold  57.26 
 
 		 587 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2248  hypothetical protein  58.06 
 
 		 585 aa  668    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.555359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1762  hypothetical protein  57.02 
 
 		 585 aa  665    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000563252 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1353  alpha/beta hydrolase fold  65.11 
 
 		 589 aa  740    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830773  normal  0.156007 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1278  alpha/beta hydrolase fold  65.28 
 
 		 599 aa  747    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3659  hypothetical protein  64.67 
 
 		 583 aa  751    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2013  hypothetical protein  58.41 
 
 		 585 aa  675    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.329786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  59.79 
 
 		 594 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2360  hypothetical protein  58.54 
 
 		 586 aa  684    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1728  Alpha/beta hydrolase fold  48.97 
 
 		 578 aa  551  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2780  hypothetical protein  48.7 
 
 		 580 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0442917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02970  alpha/beta hydrolase fold  64.85 
 
 		 332 aa  425  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0185  alpha/beta hydrolase fold protein  37.63 
 
 		 567 aa  408  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.735964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3838  hypothetical protein  41.13 
 
 		 285 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02969  alpha/beta hydrolase  63.44 
 
 		 103 aa  131  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 284 aa  90.5  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  31.74 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 302 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 302 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 302 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 277 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  27.82 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  28.03 
 
 		 306 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  30.21 
 
 		 289 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 289 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  26.89 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 313 aa  77  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  24.78 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  24.47 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 291 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 291 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 290 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  24.82 
 
 		 280 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 290 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.82 
 
 		 291 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  25.18 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 254 aa  67  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  26.59 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  23.77 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  25.63 
 
 		 288 aa  63.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  25.47 
 
 		 279 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 315 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  26.04 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  24.84 
 
 		 324 aa  62.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  26.04 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  23.05 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  21.53 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  21.86 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 328 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  25.28 
 
 		 279 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  22.91 
 
 		 276 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 257 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 		 559 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  23.14 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  21.26 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  23.02 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  22.22 
 
 		 277 aa  57  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 341 aa  56.6  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  21.79 
 
 		 263 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0547  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 263 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  22.55 
 
 		 250 aa  55.1  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 300 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>