More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0547 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0547  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
263 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  52.29 
 
 
278 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  51.36 
 
 
265 aa  238  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  49.62 
 
 
274 aa  235  6e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 
268 aa  221  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  49.61 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  36.78 
 
 
279 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  36.5 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  36.5 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  36.5 
 
 
279 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  37.31 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 
303 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 
303 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 
280 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 
280 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 
303 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  38.02 
 
 
318 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  34.85 
 
 
303 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  33.21 
 
 
277 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
277 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 
302 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 
320 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  34.87 
 
 
302 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 
313 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  36.25 
 
 
306 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 
302 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 
320 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
284 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 
267 aa  105  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  28.11 
 
 
277 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 
315 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  37.92 
 
 
286 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  32.83 
 
 
301 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 
253 aa  102  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  27.02 
 
 
277 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 
270 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
289 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  27.71 
 
 
277 aa  99  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 
303 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  27.45 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  27.45 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  33.86 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  35.11 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  27.45 
 
 
277 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  26.42 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  27.06 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  26.67 
 
 
267 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
275 aa  92.4  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  26.67 
 
 
267 aa  92  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  26.67 
 
 
267 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  26.67 
 
 
272 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5302  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289331  normal  0.304244 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  26.67 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  26.27 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
289 aa  89.7  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  35.56 
 
 
559 aa  89.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
276 aa  89  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  24.9 
 
 
279 aa  88.6  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  32.37 
 
 
314 aa  88.6  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  35.58 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  32.21 
 
 
316 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 
294 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
314 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  31.66 
 
 
279 aa  85.5  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  33.96 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  30.34 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  30.17 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
314 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  22.55 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1469  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  27.51 
 
 
585 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
290 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  28.37 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6100  predicted protein  33.33 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00681545  normal  0.399309 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  28.37 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
594 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  26.72 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3659  hypothetical protein  29.39 
 
 
583 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962134  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4520  Alpha/beta hydrolase  30.71 
 
 
589 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.71 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>