More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3281 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 263 aa  533  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  42.19 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  39.53 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  40.74 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  42.41 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  40.89 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  40.35 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  39.82 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  44.65 
 
 		 255 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  36.67 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  42.28 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  38.63 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  37.08 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  38.27 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  40.16 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  37.96 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  42.38 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  42.38 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  36.59 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  36.59 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  40.95 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  39.56 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  38.87 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  39.34 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  38.71 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  38.36 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  36.89 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  36.89 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.86 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  36.96 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  36.96 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  36.87 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  38.61 
 
 		 250 aa  152  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  38.77 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  33.18 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  38.25 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  33.48 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  44.05 
 
 		 211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  38.69 
 
 		 198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  40.72 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  40.61 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  37.28 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  41.07 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  41.51 
 
 		 217 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  40.48 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  40.25 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  40.25 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  39.63 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  40.25 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  32.86 
 
 		 246 aa  119  7e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  34.57 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  34.71 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  38.12 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  36.72 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  40.91 
 
 		 197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  30.17 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  40.14 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  31.2 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  37.41 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  27.64 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  26.36 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  34.36 
 
 		 210 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  29.39 
 
 		 535 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  30.74 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  36.63 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  36 
 
 		 349 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 		 348 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 		 349 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  29.93 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 		 219 aa  89.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  26.45 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  33.95 
 
 		 616 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  26.45 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  26.45 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 		 235 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  31.64 
 
 		 207 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.57 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  31.64 
 
 		 207 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  31.64 
 
 		 207 aa  85.5  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  34.9 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  31.64 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>