More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2280 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 590 aa  1139    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  43.63 
 
 		 583 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  45.08 
 
 		 574 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  41.88 
 
 		 629 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  41.58 
 
 		 630 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  41.87 
 
 		 632 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  40.85 
 
 		 630 aa  365  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  42.22 
 
 		 593 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  43.5 
 
 		 583 aa  361  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  45.03 
 
 		 577 aa  360  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  42.47 
 
 		 591 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.63 
 
 		 572 aa  356  5.999999999999999e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  41.16 
 
 		 595 aa  355  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  41.95 
 
 		 597 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  40.42 
 
 		 661 aa  342  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  40.42 
 
 		 661 aa  342  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  40.89 
 
 		 578 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51113  CPA2 family transporter: potassium ion efflux  41.35 
 
 		 593 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0882446  normal  0.0997387 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.86 
 
 		 680 aa  335  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  37.48 
 
 		 656 aa  333  5e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  40.73 
 
 		 664 aa  333  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  38.83 
 
 		 660 aa  333  7.000000000000001e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1239  sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 		 608 aa  331  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.333753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  40.1 
 
 		 594 aa  331  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  36.76 
 
 		 657 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  42.55 
 
 		 592 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34.91 
 
 		 568 aa  326  6e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  38.88 
 
 		 661 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  37.48 
 
 		 650 aa  325  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  38.23 
 
 		 660 aa  322  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.78 
 
 		 613 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.96 
 
 		 613 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  35.35 
 
 		 662 aa  321  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  40.98 
 
 		 661 aa  321  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  34.7 
 
 		 569 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  37.57 
 
 		 652 aa  319  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  40.28 
 
 		 533 aa  319  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.49 
 
 		 605 aa  318  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.68 
 
 		 655 aa  317  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.83 
 
 		 578 aa  317  4e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  37.08 
 
 		 616 aa  316  7e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  37.74 
 
 		 628 aa  316  8e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  39.34 
 
 		 666 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  35.71 
 
 		 601 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  41.16 
 
 		 661 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  39.47 
 
 		 674 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  35.71 
 
 		 601 aa  314  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  37.87 
 
 		 628 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.25 
 
 		 621 aa  313  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.59 
 
 		 620 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  39.93 
 
 		 665 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  38.81 
 
 		 659 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3951  potassium efflux system protein  36.47 
 
 		 657 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.959395 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  36.27 
 
 		 720 aa  312  9e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0907  sodium/hydrogen exchanger  36.25 
 
 		 563 aa  312  9e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  38.43 
 
 		 667 aa  312  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  35.7 
 
 		 654 aa  312  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  37.17 
 
 		 667 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  38 
 
 		 661 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  37.46 
 
 		 620 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  40 
 
 		 658 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  40.54 
 
 		 661 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.46 
 
 		 620 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.59 
 
 		 620 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.46 
 
 		 620 aa  310  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.4 
 
 		 620 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.46 
 
 		 620 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.46 
 
 		 620 aa  309  8e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  37.46 
 
 		 620 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.5 
 
 		 620 aa  309  8e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.5 
 
 		 620 aa  309  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.46 
 
 		 620 aa  309  8e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1572  sodium/hydrogen exchanger  42.36 
 
 		 591 aa  309  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187931  decreased coverage  0.00050527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  36.63 
 
 		 648 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.4 
 
 		 620 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  36.79 
 
 		 649 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.4 
 
 		 620 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.75 
 
 		 654 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  36.45 
 
 		 648 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.13 
 
 		 617 aa  306  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  39.62 
 
 		 602 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  36.45 
 
 		 648 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  37.23 
 
 		 668 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  36.74 
 
 		 666 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05273  hypothetical protein  38.22 
 
 		 652 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  38.83 
 
 		 663 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  36.79 
 
 		 648 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  35.91 
 
 		 649 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.61 
 
 		 635 aa  303  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1441  potassium efflux system protein  35.74 
 
 		 644 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  37.73 
 
 		 652 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000096581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.93 
 
 		 602 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0944  potassium efflux system protein  38.46 
 
 		 610 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.728384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  35.78 
 
 		 648 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3340  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.31 
 
 		 610 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5301  potassium efflux system protein  39.61 
 
 		 595 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0420  potassium efflux system protein  37.02 
 
 		 621 aa  300  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.597186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1965  sodium/hydrogen exchanger  37.5 
 
 		 594 aa  300  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  36.94 
 
 		 653 aa  300  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  36.87 
 
 		 668 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>