198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1758 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  273  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  46.46 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  55.05 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  54.13 
 
 		 132 aa  133  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  48.31 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  51.38 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  46.61 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  47.86 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  50.46 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  46.09 
 
 		 144 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  50.83 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  42.28 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  48.7 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  45.9 
 
 		 136 aa  117  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  44.83 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  41.46 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  40.68 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  36.22 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  37.5 
 
 		 319 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  37.29 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  40.15 
 
 		 319 aa  93.6  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  34.4 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  34.35 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  36 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  36.89 
 
 		 136 aa  90.5  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  34.4 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  37.1 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  34.71 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  35.25 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  37.7 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  37.6 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  34.13 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  33.93 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  37.39 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  33.9 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  39.81 
 
 		 541 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  36.07 
 
 		 155 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  32.26 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  33.61 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  36.04 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  33.61 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  36.36 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  34.17 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  31.88 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  34.43 
 
 		 550 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  34.17 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  34.43 
 
 		 550 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  34.43 
 
 		 550 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  37.93 
 
 		 312 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  29.63 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  38.98 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  34.71 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  38.79 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  32.26 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  33.91 
 
 		 548 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  33.88 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  33.58 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  37.86 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  33.91 
 
 		 548 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  29.41 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  29.91 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  35.71 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  39.02 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  34.23 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  32.77 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  34.26 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  29.75 
 
 		 311 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  26.72 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  32.81 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  30.47 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  38.6 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  29.77 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  35.24 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  32.48 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  40.62 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  31.71 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  32.48 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  32.48 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  32.48 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  34.45 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  32.48 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  32.48 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  36.45 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  27.12 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  33.64 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  33.64 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  31.01 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  31.78 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  31.03 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  35.51 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  34.45 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  30.17 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  30.17 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  31.4 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>