More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3202 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
478 aa  980  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  59.87 
 
 
477 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  59.87 
 
 
498 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  59.87 
 
 
502 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
494 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  48.25 
 
 
494 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  48.87 
 
 
494 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  48.86 
 
 
494 aa  460  1e-128  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  48.97 
 
 
509 aa  459  1e-128  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  48.86 
 
 
494 aa  460  1e-128  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  49.38 
 
 
485 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.49 
 
 
485 aa  452  1e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  48.18 
 
 
574 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  49.36 
 
 
495 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  48.68 
 
 
493 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  48.07 
 
 
570 aa  439  1e-122  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  48.48 
 
 
493 aa  440  1e-122  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
475 aa  441  1e-122  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  48.01 
 
 
504 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  45.79 
 
 
489 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.71 
 
 
490 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  45.89 
 
 
504 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  49.9 
 
 
473 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.29974e-15 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  45.29 
 
 
490 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
476 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  45.53 
 
 
491 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.1 
 
 
488 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.14 
 
 
488 aa  343  6e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
488 aa  338  1e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 
501 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 
490 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
496 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
477 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.34 
 
 
472 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
509 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  7.22465e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
509 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
493 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  35.64 
 
 
509 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  40.41 
 
 
508 aa  263  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 
470 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  36.98 
 
 
516 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
502 aa  263  7e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  36.02 
 
 
503 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  37.53 
 
 
502 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
517 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  6.15538e-06  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
502 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
502 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  36.06 
 
 
506 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  36.17 
 
 
502 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
516 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
503 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
493 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  35.71 
 
 
508 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  2.08159e-08  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
492 aa  259  9e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  38.9 
 
 
481 aa  257  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.54 
 
 
499 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2017  transcriptional regulator  34.15 
 
 
505 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.70352  normal  0.217844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
492 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  35.89 
 
 
520 aa  256  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  38.36 
 
 
501 aa  254  2e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  34.48 
 
 
476 aa  254  2e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
564 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  35.52 
 
 
561 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
564 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  35.08 
 
 
510 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
546 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  34.66 
 
 
502 aa  253  4e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  35.31 
 
 
488 aa  253  4e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  36.01 
 
 
569 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  34.36 
 
 
504 aa  253  7e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
480 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  32.84 
 
 
475 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
492 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.8 
 
 
499 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  34.71 
 
 
520 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
486 aa  250  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  36.51 
 
 
502 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
564 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  35.52 
 
 
564 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
496 aa  249  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
562 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
485 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
502 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.7 
 
 
500 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
502 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
507 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.88 
 
 
501 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
501 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
492 aa  246  5e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 
497 aa  246  5e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.08 
 
 
495 aa  246  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  33.47 
 
 
492 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.54 
 
 
489 aa  245  1e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
490 aa  245  1e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  34.92 
 
 
523 aa  245  2e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.61 
 
 
496 aa  244  2e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  36.5 
 
 
509 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.81 
 
 
504 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  36.19 
 
 
515 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.12 
 
 
507 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>