More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2449 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  767    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  59.14 
 
 		 405 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  58.97 
 
 		 405 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  58.51 
 
 		 405 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  59.73 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  58.88 
 
 		 404 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  59.73 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  59.47 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  60.43 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  58.49 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  58.38 
 
 		 404 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  58.49 
 
 		 398 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  57.66 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  57.66 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  57.66 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  63.73 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  61.05 
 
 		 388 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  64.04 
 
 		 399 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  62.24 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  62.24 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  60.66 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  62.57 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  50.65 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  46 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  44.53 
 
 		 389 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  44.53 
 
 		 389 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  46.72 
 
 		 398 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  48.6 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  47.79 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  48.47 
 
 		 413 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  44.32 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  46.92 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  51.27 
 
 		 413 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  43.37 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 405 aa  266  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 408 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  51.39 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 399 aa  252  8.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 399 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 399 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 		 447 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 399 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 416 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  36.01 
 
 		 403 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  35.48 
 
 		 392 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  36.01 
 
 		 406 aa  235  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  36.01 
 
 		 406 aa  235  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  43.88 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  40.44 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  43.35 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  43.35 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  43.35 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  43.35 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  41.76 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  41.76 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  41.76 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  41.76 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  41.49 
 
 		 394 aa  229  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 		 406 aa  227  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  41.14 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  42.02 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 406 aa  222  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 413 aa  219  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 395 aa  212  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 421 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  39.41 
 
 		 422 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 403 aa  209  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 426 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 407 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 399 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  40 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 383 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  43.39 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 403 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  39.67 
 
 		 389 aa  199  9e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 403 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  41.06 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 		 419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>