93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1721 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 317 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  70.07 
 
 		 343 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  66.56 
 
 		 320 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  66.24 
 
 		 343 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  64.95 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  64.98 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  64.67 
 
 		 320 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  64.87 
 
 		 319 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  64.67 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  60.07 
 
 		 323 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  59.59 
 
 		 327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  44.63 
 
 		 321 aa  247  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  43.94 
 
 		 424 aa  247  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  47.93 
 
 		 319 aa  232  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  41.07 
 
 		 316 aa  218  7.999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  42.09 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  37.7 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  44.56 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  32.61 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  33.44 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  36.56 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  28.57 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  28.57 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  28.57 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  27.68 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  29.04 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  27.11 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  27.11 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  27.48 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  27.3 
 
 		 580 aa  86.3  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.46 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.46 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  29.67 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  28.67 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  29.67 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  30.92 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  25.49 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  28.26 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  30.99 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  29.37 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  28.07 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  27.96 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0517  putative secreted protein  28.8 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  22.26 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02988  hypothetical protein  32.95 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  24.75 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0131  putative secreted protein  28.76 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.72 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5534  hypothetical protein  36.45 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3509  Dienelactone hydrolase  29.89 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  24.65 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0141  putative secreted protein  28.52 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0150  putative secreted protein  28.52 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  22.4 
 
 		 442 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  24.24 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  24.3 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1040  dienelactone hydrolase  24.67 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0151  putative secreted protein  26.84 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0155783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1510  alpha/beta fold family hydrolase  27.54 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  25.8 
 
 		 512 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  25.8 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  25.09 
 
 		 512 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  28.36 
 
 		 474 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  25.96 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  23.92 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  26.19 
 
 		 460 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2039  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.31 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.01 
 
 		 518 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  25.62 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0470  hypothetical protein  38.46 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  30.6 
 
 		 473 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20570  alpha/beta hydrolase fold protein  30.21 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  31.25 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  24.05 
 
 		 269 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4242  hypothetical protein  37.18 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328451 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  29.88 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  26.29 
 
 		 460 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  22.7 
 
 		 517 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  25.09 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4227  putative bioH protein  21.94 
 
 		 246 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  26.88 
 
 		 460 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4250  putative bioH protein  22.45 
 
 		 246 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.82 
 
 		 626 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1010  putative bioH protein  21.94 
 
 		 246 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>