74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1672 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  301  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  75 
 
 		 150 aa  216  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  69.18 
 
 		 146 aa  206  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  68.46 
 
 		 145 aa  203  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  68.46 
 
 		 145 aa  203  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  67.12 
 
 		 146 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  74.02 
 
 		 133 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  54.01 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  51.7 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  52.55 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  53.57 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  37.76 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  40.38 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  38.05 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  38.71 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  35 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  33.04 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  32.26 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  28.91 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  31 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  37.04 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  44.12 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  30.1 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  33.94 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  36.9 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  29.59 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  35.44 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  38.55 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  31.58 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  34.21 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  25.9 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  29 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  34.21 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  33.78 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  37.68 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  35.94 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  29.41 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  35.8 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  29.79 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  38.18 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  56.76 
 
 		 386 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  36.73 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  46 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  46 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  45.71 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  43.55 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  31 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  46 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  36.36 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  37.88 
 
 		 116 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  43.94 
 
 		 114 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  54.84 
 
 		 127 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  34.43 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  52.78 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  52.78 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  33.33 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  37.04 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  48.89 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  40.82 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  31.65 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  55.88 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  62.07 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  58.33 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  46.88 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  48.65 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  23.08 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  47.06 
 
 		 121 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>