33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1529 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 		 120 aa  223  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  50.46 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  42.55 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  47.62 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  36.45 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  40.45 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0911  hypothetical protein  51.76 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.559623  normal  0.647465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  38.36 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  39.02 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  35.56 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  38.2 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  33.7 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  29.63 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  43.08 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  38.89 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  35.94 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  31.33 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  40.62 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  40.62 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  23.53 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  23.53 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  40.62 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  33.04 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  40.62 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  26.44 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  32.86 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  26.88 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  36.07 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0811  protein of unknown function DUF1232  41.79 
 
 		 149 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  38.81 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  26.97 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  45.24 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  26.67 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>