More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1722 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  100 
 
 		 348 aa  719    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  64.99 
 
 		 337 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  62.5 
 
 		 357 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  59.76 
 
 		 360 aa  404  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  56.07 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  49.57 
 
 		 351 aa  331  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  47.65 
 
 		 345 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  46.36 
 
 		 350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  47.11 
 
 		 347 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  47.11 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  48.62 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  46.36 
 
 		 350 aa  291  9e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  46.92 
 
 		 349 aa  289  4e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  41.76 
 
 		 364 aa  289  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  44.02 
 
 		 354 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  45.82 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  43.7 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  45.54 
 
 		 341 aa  275  9e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  44.12 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  42.69 
 
 		 372 aa  272  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  42.2 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  43.53 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  43.4 
 
 		 352 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  40.94 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  41.69 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  42.69 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  43.07 
 
 		 359 aa  259  7e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  44.41 
 
 		 352 aa  256  5e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  44.84 
 
 		 323 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  41.52 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  43.44 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  43.73 
 
 		 370 aa  252  8.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  45.14 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  40.36 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  38.58 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 380 aa  225  8e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  40.62 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  40.13 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  28.9 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  27.12 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  24.36 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  27.31 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.14 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  25.16 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.87 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  30.8 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.43 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  23.72 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.42 
 
 		 466 aa  72.8  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  28.4 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  29.07 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.01 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.76 
 
 		 469 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.56 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.03 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  25.25 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  25 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  25 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.17 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  23.49 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  25.27 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  27.23 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.55 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.37 
 
 		 469 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  25.6 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  24.54 
 
 		 475 aa  66.2  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  27.23 
 
 		 383 aa  65.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  25.98 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  24.29 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.82 
 
 		 468 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.6 
 
 		 477 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  24.29 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.38 
 
 		 470 aa  62.8  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.32 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  23.33 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.96 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  24.73 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.33 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  27.24 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  23.08 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.47 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  28.05 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  25.83 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.3 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  25.83 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1557  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.36 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.190528  normal  0.123415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.44 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  24 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.23 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  26.84 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.67 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  25 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.25 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  25 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.02 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.38 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.31 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.57 
 
 		 473 aa  57  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>