More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0050 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  100 
 
 
407 aa  842  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  67.97 
 
 
393 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  64.08 
 
 
389 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  66.49 
 
 
404 aa  545  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  64.01 
 
 
391 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  63.04 
 
 
396 aa  531  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  64.34 
 
 
389 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  62.21 
 
 
391 aa  529  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  62.18 
 
 
394 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  61.54 
 
 
391 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  63.57 
 
 
389 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  62.83 
 
 
402 aa  518  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  63.09 
 
 
384 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  61.34 
 
 
388 aa  515  1e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  62.34 
 
 
400 aa  517  1e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  62.24 
 
 
400 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  60.52 
 
 
386 aa  494  1e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  58.55 
 
 
404 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  60.42 
 
 
402 aa  492  1e-138  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  60.31 
 
 
398 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  58.33 
 
 
400 aa  483  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  59.95 
 
 
401 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  59.44 
 
 
400 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  59.95 
 
 
401 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  57.92 
 
 
399 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  57.66 
 
 
402 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  60.99 
 
 
401 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  57.54 
 
 
400 aa  469  1e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  57.89 
 
 
397 aa  469  1e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  9.44956e-06 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  55.72 
 
 
402 aa  461  1e-128  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  56.07 
 
 
400 aa  447  1e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  53.4 
 
 
388 aa  431  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  56.2 
 
 
404 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  51.3 
 
 
396 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.40569e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  51.42 
 
 
392 aa  405  1e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  56.36 
 
 
404 aa  407  1e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  56.17 
 
 
397 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  53.39 
 
 
410 aa  400  1e-110  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  52.43 
 
 
387 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  52.86 
 
 
407 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  49.1 
 
 
394 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  51.28 
 
 
388 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 
398 aa  391  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.01074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  50.51 
 
 
398 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  50 
 
 
398 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  49.11 
 
 
398 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  51.44 
 
 
407 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  49.11 
 
 
398 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  50.79 
 
 
399 aa  389  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  51.03 
 
 
387 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  49.87 
 
 
384 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  49.61 
 
 
392 aa  388  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.44 
 
 
414 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.61511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  50.78 
 
 
396 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  49.08 
 
 
384 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  49.48 
 
 
398 aa  378  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  50 
 
 
393 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  48.31 
 
 
388 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.31678e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  50.52 
 
 
404 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 
402 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  6.04426e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50.27 
 
 
379 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.69 
 
 
382 aa  374  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  47.04 
 
 
394 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.84465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  49.48 
 
 
396 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  48.45 
 
 
400 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  50.9 
 
 
394 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  48.04 
 
 
389 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  50.26 
 
 
390 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.98 
 
 
403 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  50.66 
 
 
378 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  52.2 
 
 
392 aa  362  5e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  47.14 
 
 
393 aa  359  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  46.8 
 
 
417 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  48.8 
 
 
394 aa  359  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  46.3 
 
 
383 aa  355  9e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  8.17205e-07 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  47.53 
 
 
386 aa  353  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  45.41 
 
 
382 aa  350  3e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  47.31 
 
 
409 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  46.6 
 
 
405 aa  349  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  45.38 
 
 
422 aa  348  8e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  44.58 
 
 
403 aa  348  9e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  50.67 
 
 
380 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  45.64 
 
 
410 aa  347  3e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  47.64 
 
 
396 aa  345  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  45.98 
 
 
404 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  45.98 
 
 
404 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  45.98 
 
 
404 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  45.98 
 
 
404 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  45.98 
 
 
404 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  44.19 
 
 
407 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  44.19 
 
 
407 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  44.7 
 
 
407 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  44.7 
 
 
407 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  45.98 
 
 
404 aa  342  6e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  44.7 
 
 
407 aa  342  6e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  45.98 
 
 
404 aa  342  6e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  45.98 
 
 
404 aa  342  6e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  45.98 
 
 
404 aa  342  6e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  45.98 
 
 
404 aa  342  6e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  46.23 
 
 
404 aa  342  6e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>