275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1035 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1915  serine protease  41.27 
 
 		 1300 aa  799    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  35.3 
 
 		 1634 aa  725    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.88 
 
 		 1312 aa  768    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.03 
 
 		 1649 aa  709    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  41.65 
 
 		 1298 aa  781    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  41.33 
 
 		 1265 aa  791    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.69 
 
 		 1645 aa  666    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  41.7 
 
 		 1298 aa  783    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 		 1474 aa  2978    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.49 
 
 		 1648 aa  661    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  34.89 
 
 		 1705 aa  691    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.28 
 
 		 1638 aa  707    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.28 
 
 		 1638 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  42.27 
 
 		 1258 aa  784    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  34.75 
 
 		 1705 aa  691    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.49 
 
 		 1648 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.7 
 
 		 1293 aa  828    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.35 
 
 		 1648 aa  646    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  42.18 
 
 		 1300 aa  800    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.66 
 
 		 1669 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.17 
 
 		 1706 aa  676    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  35.22 
 
 		 1639 aa  726    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  33.74 
 
 		 1638 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  35.57 
 
 		 1683 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  34.8 
 
 		 1739 aa  690    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  41.35 
 
 		 1298 aa  777    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.62 
 
 		 1659 aa  699    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  41.52 
 
 		 1298 aa  778    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.18 
 
 		 1705 aa  698    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  37.8 
 
 		 1287 aa  630  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  32.9 
 
 		 1725 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.07 
 
 		 1199 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.22 
 
 		 1649 aa  602  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  43.59 
 
 		 1109 aa  569  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.73 
 
 		 1399 aa  561  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1406 aa  532  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  34.5 
 
 		 1099 aa  353  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  31.23 
 
 		 983 aa  333  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  32.83 
 
 		 1312 aa  327  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.61 
 
 		 1099 aa  325  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  37.75 
 
 		 1116 aa  321  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  38.05 
 
 		 1115 aa  314  9e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.07 
 
 		 1000 aa  279  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.43 
 
 		 1283 aa  278  8e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  30.39 
 
 		 994 aa  272  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  28.91 
 
 		 1042 aa  272  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  30.75 
 
 		 1006 aa  265  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  28.96 
 
 		 1109 aa  264  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  29.57 
 
 		 971 aa  255  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  28.84 
 
 		 1321 aa  243  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  28.28 
 
 		 1045 aa  240  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.45 
 
 		 1286 aa  241  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.3 
 
 		 1292 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.56 
 
 		 1160 aa  183  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  32.56 
 
 		 1035 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.43 
 
 		 728 aa  147  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  24.44 
 
 		 1407 aa  144  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  24.44 
 
 		 1407 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  25.3 
 
 		 917 aa  142  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  24.5 
 
 		 1406 aa  141  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  24.51 
 
 		 917 aa  140  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1407 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  25.15 
 
 		 917 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  25 
 
 		 917 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  25 
 
 		 917 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.39 
 
 		 915 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  25.3 
 
 		 917 aa  134  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  24.7 
 
 		 917 aa  133  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  24.16 
 
 		 917 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.91 
 
 		 891 aa  132  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  24.85 
 
 		 917 aa  131  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  24.31 
 
 		 1570 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.89 
 
 		 1776 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  23.68 
 
 		 1570 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  26.29 
 
 		 1809 aa  112  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  30.96 
 
 		 962 aa  108  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.24 
 
 		 860 aa  107  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  25.38 
 
 		 1570 aa  106  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  26.54 
 
 		 1618 aa  103  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  24.24 
 
 		 2042 aa  100  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.06 
 
 		 1124 aa  100  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.48 
 
 		 1565 aa  99.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.98 
 
 		 860 aa  97.8  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  27.52 
 
 		 1221 aa  95.1  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.03 
 
 		 660 aa  90.9  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  84.44 
 
 		 1503 aa  88.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.79 
 
 		 1323 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.34 
 
 		 1212 aa  86.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  23.16 
 
 		 1215 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.32 
 
 		 1383 aa  84.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.78 
 
 		 883 aa  82.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.2 
 
 		 1060 aa  81.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  26.95 
 
 		 1220 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0731  hypothetical protein  30.23 
 
 		 235 aa  80.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0392  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.87 
 
 		 1075 aa  77.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.81 
 
 		 1212 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.81 
 
 		 1212 aa  76.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.68 
 
 		 1234 aa  76.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.81 
 
 		 1212 aa  76.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  56.67 
 
 		 1171 aa  75.5  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>