More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2372 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 463 aa  967    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  43.35 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  35.59 
 
 		 462 aa  299  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  32.36 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  29.52 
 
 		 453 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  36.07 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 		 461 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  33.17 
 
 		 476 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 489 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 		 447 aa  186  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  29.6 
 
 		 450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  31.28 
 
 		 460 aa  183  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  30.35 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  31.09 
 
 		 484 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  32.07 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  31.23 
 
 		 473 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  30.41 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 476 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  28.54 
 
 		 476 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 476 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 476 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 476 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.45 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  29.4 
 
 		 462 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  30.57 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  29 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 430 aa  123  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 467 aa  113  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 442 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 442 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 507 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 436 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 518 aa  99  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 385 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 385 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 		 484 aa  95.9  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  37.01 
 
 		 481 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  26.04 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  26.04 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 		 290 aa  94.4  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 499 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  26.41 
 
 		 391 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 365 aa  90.9  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  26.41 
 
 		 391 aa  90.9  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 474 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 344 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.43 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 400 aa  89  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.14 
 
 		 398 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 447 aa  86.7  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.14 
 
 		 398 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.14 
 
 		 398 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.14 
 
 		 398 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  25 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.86 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  39.61 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  22.76 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  22.52 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.74 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  35.51 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.63 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.74 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.32 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  26.02 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>