More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0787 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  100 
 
 
128 aa  261  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  63.78 
 
 
138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  60.33 
 
 
138 aa  141  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  54.76 
 
 
139 aa  141  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  51.24 
 
 
154 aa  123  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  47.9 
 
 
141 aa  114  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
138 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  49.55 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  46.22 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  49.14 
 
 
133 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  48.67 
 
 
129 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 
129 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 
129 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  37.29 
 
 
137 aa  101  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  42.4 
 
 
142 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  42.74 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  42.4 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  43.22 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
135 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  44.07 
 
 
137 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  42.62 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  43.9 
 
 
136 aa  92  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  39.34 
 
 
352 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 
129 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  44.92 
 
 
150 aa  90.5  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  41.38 
 
 
129 aa  90.1  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
138 aa  90.1  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  45.08 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  45.08 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 
134 aa  90.1  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  43.44 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
133 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  41.53 
 
 
138 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  38.52 
 
 
352 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  44.83 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  44.26 
 
 
132 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  42.4 
 
 
144 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  41.53 
 
 
138 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  37.39 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 
386 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  34.96 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  44.92 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
334 aa  87.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
138 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 
138 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  45.22 
 
 
383 aa  87  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 
363 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  45.61 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  38.46 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  39.83 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  39.67 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  45.95 
 
 
138 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  45.95 
 
 
138 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  43.86 
 
 
313 aa  83.6  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
133 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  36.44 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  42.15 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  40.52 
 
 
314 aa  81.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  37.4 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  38.4 
 
 
347 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
200 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  36.97 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  37.07 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.8 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  36.84 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  43.86 
 
 
315 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.83 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  37.07 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  33.87 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  36.84 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  36.59 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  43.86 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.83 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  41.23 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  42.11 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  41.23 
 
 
316 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  40 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  39.84 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  37.93 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>