44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0399 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  470  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  49.38 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  47.37 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  45.96 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  41.47 
 
 		 243 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  40.77 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  42.27 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  41.03 
 
 		 194 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  41.43 
 
 		 197 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  42.5 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  38.1 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  33.05 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  28.88 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  32.49 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  30.69 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  30.34 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  31.78 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  29.24 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  30.38 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  31.78 
 
 		 183 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  29.91 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  32.38 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  27.01 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  26.98 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  27.54 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  27.78 
 
 		 222 aa  72  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  34.46 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  27.05 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  28.64 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  26.25 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  27.23 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  28.38 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  28.38 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  27.93 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  27.48 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  28.44 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  30.92 
 
 		 373 aa  48.9  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  27.52 
 
 		 401 aa  48.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  27.72 
 
 		 373 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  29.07 
 
 		 297 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  27.69 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  26.67 
 
 		 357 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  25.76 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2179  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>