44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0399 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  470  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  9.21027e-11  unclonable  2.18864e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  49.38 
 
 
229 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  3.21544e-08  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  47.37 
 
 
237 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.65073e-06  hitchhiker  3.18846e-05 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  45.96 
 
 
222 aa  179  3e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.64582e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  41.47 
 
 
243 aa  171  7e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  2.19065e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  40.77 
 
 
249 aa  152  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  4.60026e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  42.27 
 
 
231 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  4.90319e-08  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  41.03 
 
 
194 aa  141  1e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  41.43 
 
 
197 aa  134  2e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  4.99206e-11  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  42.5 
 
 
227 aa  130  2e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  38.1 
 
 
227 aa  116  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  33.05 
 
 
212 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  28.88 
 
 
201 aa  94.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  32.49 
 
 
203 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  1.6508e-06  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  30.69 
 
 
202 aa  89  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  30.34 
 
 
206 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  31.78 
 
 
202 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  7.93309e-08  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  29.24 
 
 
213 aa  83.2  3e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.66058e-13 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  30.38 
 
 
215 aa  82.8  4e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  2.37774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  31.78 
 
 
183 aa  81.6  1e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  32.38 
 
 
190 aa  77.8  1e-13  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  4.33571e-07  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  29.91 
 
 
195 aa  77.8  1e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  9.82114e-11  unclonable  6.60987e-07 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  27.01 
 
 
195 aa  77  2e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  26.98 
 
 
219 aa  73.6  2e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  27.54 
 
 
209 aa  73.6  3e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  7.77895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  27.78 
 
 
222 aa  72  8e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  34.46 
 
 
196 aa  71.2  1e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  5.83804e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  27.05 
 
 
224 aa  68.9  6e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  28.64 
 
 
186 aa  68.9  7e-11  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  26.25 
 
 
224 aa  67.8  2e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  27.23 
 
 
190 aa  64.3  1e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  1.02603e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  28.38 
 
 
239 aa  61.6  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  28.38 
 
 
239 aa  61.6  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  27.93 
 
 
239 aa  59.3  5e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  27.48 
 
 
239 aa  57.8  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  28.44 
 
 
219 aa  57  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  30.92 
 
 
373 aa  48.9  7e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  27.52 
 
 
401 aa  48.5  9e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  27.72 
 
 
373 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  29.07 
 
 
297 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  27.69 
 
 
364 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  26.67 
 
 
357 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  25.76 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2179  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>