More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03092 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  100 
 
 		 285 aa  545  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  78.6 
 
 		 298 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  47.5 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  33.57 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  37.46 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  35.99 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  36.14 
 
 		 309 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  34.95 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  31.85 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  32.07 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  36.3 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  37.22 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  31.54 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  33.68 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  32.75 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  35.98 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  35.98 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  30.77 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  35.91 
 
 		 333 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  32.61 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  33.46 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.24 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  35.46 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  33.56 
 
 		 347 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.75 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  34.94 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  33.69 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  31.9 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  32.99 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  32.65 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  32.99 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  34.05 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.37 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  31.79 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  31.8 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  34.08 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  31.8 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  31.25 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.1 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  29.86 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  30.77 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.42 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  31.1 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  30.6 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  32.49 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  36.3 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  31.36 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  28.97 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  29.79 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  28.97 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  32.13 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  28.93 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  30.87 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  30.74 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.18 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.43 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  29.49 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.08 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  33.58 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  30.93 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  31.2 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  30.95 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2496  hypothetical protein  28.72 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.580148 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  30.4 
 
 		 312 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  32.26 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.6 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  29.69 
 
 		 342 aa  95.9  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  34.64 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  30.85 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 312 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 		 302 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  29.39 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  30.83 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  29.2 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  29.5 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  34.66 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  28.27 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.52 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  31.72 
 
 		 314 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  31.16 
 
 		 313 aa  92.8  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  31.18 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  26.69 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  29.24 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  25.98 
 
 		 281 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  29.33 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  29.5 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  25.98 
 
 		 281 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.9 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  29.96 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>