108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6051 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  82.53 
 
 		 291 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  81.93 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  73.49 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  50.63 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  48.75 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  48.75 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  46.41 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  47.06 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  47.06 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  34.21 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  46.15 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3173  hypothetical protein  47.55 
 
 		 237 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6856  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  47.55 
 
 		 198 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  35.33 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  37.41 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  38.93 
 
 		 276 aa  89  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  38.16 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  36.05 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  36.54 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  33.11 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  37.25 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  34.46 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  33.12 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  33.57 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  35 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  35.29 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  32.65 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.71 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7639  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.29 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836556 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  41.03 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  29.75 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  32.78 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  32.78 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  35.06 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.5 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.71 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  33.88 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.88 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  30.67 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  30.67 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  30.67 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  31.13 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1501  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.45 
 
 		 181 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124418  hitchhiker  0.00011346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.11 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3209  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.59 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3347  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.59 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  30.89 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  31.97 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3157  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.29 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.660843  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  42.31 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5534  plasmid pRiA4b ORF-3-like  31.01 
 
 		 196 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.56 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  28.19 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  27.7 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3350  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.38 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  38.37 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4150  hypothetical protein  31.86 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.64 
 
 		 181 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.64 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  41.27 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1546  ORF-3 family protein  43.75 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0403553 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3019  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.92 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5189  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  44.78 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2272  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  29.38 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  29.73 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4882  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.33 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  30.61 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.66 
 
 		 482 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.66 
 
 		 482 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40.85 
 
 		 561 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.66 
 
 		 482 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.33 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.66 
 
 		 482 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  42.25 
 
 		 233 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1138  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.84 
 
 		 442 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1921  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.82 
 
 		 196 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5199  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.88 
 
 		 471 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04841  hypothetical protein  29.25 
 
 		 196 aa  50.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  27.59 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4625  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.13 
 
 		 464 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  32 
 
 		 188 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  42.86 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  40.74 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  40.74 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  40.74 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  40.74 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  40.74 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  40.74 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  40 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  32.65 
 
 		 189 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  25.68 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0548  hypothetical protein  36.14 
 
 		 212 aa  46.2  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4604  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  44.44 
 
 		 220 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>