More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39568 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  100 
 
 
103 aa  209  9e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  54.46 
 
 
189 aa  114  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  53.75 
 
 
165 aa  101  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  51.11 
 
 
108 aa  100  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  45.74 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  47 
 
 
104 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  45.26 
 
 
104 aa  93.6  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  45.54 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.30429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  45.54 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  7.62931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  47.62 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  46.67 
 
 
108 aa  92.8  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  44.55 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  44.55 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  43.16 
 
 
104 aa  90.9  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  47.31 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  48.19 
 
 
108 aa  90.1  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  49.45 
 
 
106 aa  90.1  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  44.44 
 
 
102 aa  90.1  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  43.96 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  45.26 
 
 
110 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  46.43 
 
 
107 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  46.74 
 
 
106 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  49.38 
 
 
115 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  46 
 
 
102 aa  89  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  9.42681e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  49.46 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  47.5 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  47.37 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  51.95 
 
 
104 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  46.24 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  44.32 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  44.32 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  41.67 
 
 
238 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  54.67 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  44.71 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  54.67 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  41.84 
 
 
330 aa  87.8  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  54.67 
 
 
104 aa  87  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  48.81 
 
 
108 aa  87  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  44.58 
 
 
108 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  42.05 
 
 
259 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  45.65 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  45.78 
 
 
223 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  42.16 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  41.76 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  40.7 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  46.74 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  44.94 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  43.96 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  47.5 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  47.25 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  40.45 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  43.18 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  44.57 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  2.24157e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  40.2 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  39.08 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  43.01 
 
 
105 aa  84.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  44.44 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  45.78 
 
 
107 aa  84.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  46.15 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  47.19 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  45.78 
 
 
107 aa  84.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  44.05 
 
 
107 aa  84.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  40.43 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  42.05 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  42.05 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  42.86 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  46.91 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  45.78 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  52.56 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.01022e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  45.68 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  44.19 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  45.68 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  41.86 
 
 
104 aa  84.3  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  42.7 
 
 
105 aa  84  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  40.24 
 
 
109 aa  84  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  44.58 
 
 
112 aa  84  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  45.65 
 
 
106 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  43.53 
 
 
102 aa  84  7e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  48.75 
 
 
107 aa  84  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  39.78 
 
 
106 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  41.86 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  3.64045e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  42.39 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  46.74 
 
 
106 aa  83.6  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  45.24 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  43.82 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  44.44 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  43.18 
 
 
130 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  43.82 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  44.58 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  45.65 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  42 
 
 
109 aa  83.2  1e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  44.58 
 
 
107 aa  83.2  1e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  46.59 
 
 
104 aa  83.2  1e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.56705e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  44.58 
 
 
107 aa  83.2  1e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  45.36 
 
 
110 aa  83.6  1e-15  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  43.82 
 
 
108 aa  83.2  1e-15  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  41.94 
 
 
102 aa  83.2  1e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  4.49088e-15 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  44.3 
 
 
108 aa  83.2  1e-15  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  40 
 
 
104 aa  82.8  1e-15  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  7.29683e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>