More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17720 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  100 
 
 		 678 aa  1404    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  40.66 
 
 		 630 aa  459  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0405652 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  31.65 
 
 		 708 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24496  predicted protein  32.07 
 
 		 667 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  31.6 
 
 		 727 aa  293  5e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  29.67 
 
 		 753 aa  286  9e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  31.14 
 
 		 718 aa  276  6e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49655  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 2 (Long-chain acyl-CoA synthetase 2) (Fatty acid activator 2)  31.99 
 
 		 751 aa  261  3e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89450  long-chain-fatty-acid CoA ligase  29.86 
 
 		 720 aa  259  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.67886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20143  long chain acyl-coa synthetase  29.54 
 
 		 721 aa  251  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65071  long-chain fatty acid--CoA ligase and synthetase 4  29.74 
 
 		 699 aa  250  7e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.418644  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 592 aa  250  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55002  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.34 
 
 		 752 aa  244  3.9999999999999997e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.16 
 
 		 610 aa  244  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 610 aa  244  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 649 aa  243  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 610 aa  243  7.999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 607 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06014  fatty acid activator Faa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09910)  29.66 
 
 		 698 aa  241  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.547026 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 660 aa  241  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 633 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  30.41 
 
 		 706 aa  238  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 603 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 603 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 637 aa  234  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 602 aa  233  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 610 aa  233  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.84 
 
 		 602 aa  232  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  28.55 
 
 		 603 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 605 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 630 aa  231  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 604 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.72 
 
 		 599 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 604 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 685 aa  227  6e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 604 aa  226  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 616 aa  226  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 595 aa  226  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 		 596 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 652 aa  223  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 		 607 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 		 592 aa  222  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 		 669 aa  222  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 620 aa  221  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 		 617 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 604 aa  221  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  29.84 
 
 		 592 aa  221  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 594 aa  220  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 616 aa  220  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 612 aa  220  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.47 
 
 		 610 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 591 aa  217  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 602 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 602 aa  217  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 602 aa  217  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 615 aa  216  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 609 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 597 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 672 aa  216  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 598 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 596 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 591 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 616 aa  214  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  33.48 
 
 		 592 aa  213  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 598 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 590 aa  213  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 606 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.78 
 
 		 587 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 601 aa  212  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 580 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 612 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 598 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  29.54 
 
 		 607 aa  211  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  27.42 
 
 		 602 aa  210  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  31.24 
 
 		 580 aa  210  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 613 aa  210  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 605 aa  210  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 606 aa  210  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 602 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.99 
 
 		 602 aa  209  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 598 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 606 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  30.09 
 
 		 702 aa  209  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 		 602 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 		 590 aa  208  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 597 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 597 aa  208  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 597 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  28.5 
 
 		 600 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 605 aa  207  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 623 aa  207  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 		 601 aa  206  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 639 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 639 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  27.5 
 
 		 610 aa  206  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 660 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 		 597 aa  206  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  29.12 
 
 		 568 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 		 599 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>