More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1065 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1094  Ribonuclease H  100 
 
 
205 aa  414  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1065  Ribonuclease H  100 
 
 
205 aa  414  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0043  Ribonuclease H  69.52 
 
 
212 aa  244  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.618415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  61.38 
 
 
225 aa  236  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  59.57 
 
 
221 aa  229  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  62.7 
 
 
211 aa  225  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  53.76 
 
 
215 aa  192  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  52.49 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  50.26 
 
 
209 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  52.13 
 
 
209 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  52.13 
 
 
209 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  49.21 
 
 
199 aa  168  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  51.35 
 
 
338 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  49.47 
 
 
240 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  49.46 
 
 
202 aa  166  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  49.46 
 
 
202 aa  166  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50.53 
 
 
208 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  48.98 
 
 
201 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  48.47 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  50.27 
 
 
211 aa  164  8e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  48.98 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  50.53 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  52.88 
 
 
207 aa  161  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  48.73 
 
 
208 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  54.26 
 
 
260 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50.54 
 
 
198 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  47.96 
 
 
217 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  47.67 
 
 
214 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  51.35 
 
 
218 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  48.37 
 
 
198 aa  158  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  45.5 
 
 
210 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  48.9 
 
 
198 aa  158  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  46.35 
 
 
249 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  47.31 
 
 
206 aa  157  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  49.23 
 
 
202 aa  158  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  47.15 
 
 
214 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  48.96 
 
 
214 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  47.15 
 
 
214 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  47.15 
 
 
214 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  46.43 
 
 
214 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  45.45 
 
 
214 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  48.96 
 
 
214 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  48.96 
 
 
214 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  48.68 
 
 
206 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  48.96 
 
 
214 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  50.27 
 
 
199 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  48.96 
 
 
214 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  46.74 
 
 
212 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  49.18 
 
 
202 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  48.96 
 
 
214 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  44.68 
 
 
201 aa  155  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  47.45 
 
 
207 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  48.44 
 
 
214 aa  155  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  48.4 
 
 
283 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  47.03 
 
 
204 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  47.87 
 
 
283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  48.96 
 
 
214 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  46.35 
 
 
248 aa  154  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  46.63 
 
 
210 aa  154  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  46.35 
 
 
248 aa  154  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  47.87 
 
 
283 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  45.92 
 
 
218 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  47.69 
 
 
203 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  46.32 
 
 
227 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  45.41 
 
 
217 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  51.38 
 
 
267 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  47.25 
 
 
203 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  48.68 
 
 
230 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  45.41 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  47.28 
 
 
268 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  45.6 
 
 
198 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  44.85 
 
 
198 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  45.6 
 
 
198 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  44.85 
 
 
198 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  45.6 
 
 
198 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  44.85 
 
 
198 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  46.96 
 
 
191 aa  151  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  49.19 
 
 
210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  48.76 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  45.36 
 
 
230 aa  151  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  45.92 
 
 
207 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  45.55 
 
 
230 aa  151  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  50 
 
 
308 aa  151  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  44.85 
 
 
198 aa  151  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  42.79 
 
 
210 aa  150  8.999999999999999e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  45.08 
 
 
198 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  47.83 
 
 
198 aa  150  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  45.11 
 
 
211 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  44.85 
 
 
198 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  47.8 
 
 
216 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  44.85 
 
 
198 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  45.08 
 
 
198 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  45.08 
 
 
198 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  47.12 
 
 
213 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  44.85 
 
 
198 aa  149  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  45.99 
 
 
236 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  48.4 
 
 
193 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  44.85 
 
 
198 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  48.13 
 
 
229 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  44.85 
 
 
198 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>