More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0094 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0094  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 
294 aa  607  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0091  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  95.92 
 
 
294 aa  584  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1563  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  68.75 
 
 
295 aa  414  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3653  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  63.54 
 
 
294 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2554  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  57.99 
 
 
292 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  48.96 
 
 
294 aa  308  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1967  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.65 
 
 
308 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1255  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.56 
 
 
293 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.463201  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3226  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.62 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.64 
 
 
305 aa  136  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0477  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.12 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.0000000000065602  decreased coverage  0.00000000361225 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1426  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.47 
 
 
288 aa  129  8.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.41063  hitchhiker  0.00349813 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1084  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.18 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0125965  normal  0.0422522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2324  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.41 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1313  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.21 
 
 
276 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3414  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.15 
 
 
303 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4815  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.03 
 
 
299 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0494  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.81 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4601  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.85 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.14 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.10972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0551  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.02 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2145  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.63 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.292783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0588  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.23 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0589  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.44 
 
 
285 aa  116  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0766528  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0424  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.35 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4174  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.19 
 
 
306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1216  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.39 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.06 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217368  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0452  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.01 
 
 
304 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3878  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.01 
 
 
304 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0509  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.66 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0462  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.01 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.79 
 
 
473 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0328  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.32 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0436  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.3 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2262  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.85 
 
 
294 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08032  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02240)  26.53 
 
 
314 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.019625  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2507  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.12 
 
 
272 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3531  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.1 
 
 
306 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3709  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.76 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
286 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2856  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.12 
 
 
285 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0978379  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0794  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  27.36 
 
 
294 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5752  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.62 
 
 
321 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6116  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.62 
 
 
321 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2763  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.17 
 
 
295 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6598  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.62 
 
 
321 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456488 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4291  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.12 
 
 
298 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0823  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  26.69 
 
 
294 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1998  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.07 
 
 
302 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000898814  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7602  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.28 
 
 
314 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6045  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.19 
 
 
333 aa  99.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.351702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1509  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.96 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0850  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.04 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3053  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.54 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.07 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1177  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.36 
 
 
277 aa  95.9  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0481  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.67 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0599  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.67 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4446  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.64 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02230  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0219255  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1385  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.04 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4428  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.76 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.07 
 
 
286 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0122  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.24 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3934  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.62 
 
 
301 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2138  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.52 
 
 
296 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0637  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.08 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.618272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1984  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.92 
 
 
301 aa  92.4  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0049  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25 
 
 
310 aa  92.4  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6087  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.68 
 
 
317 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25518  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0232  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.21 
 
 
270 aa  92.4  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488037  normal  0.41258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.92 
 
 
279 aa  92.4  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27418  hitchhiker  0.000721041 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.08 
 
 
278 aa  92  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.22 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2525  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.74 
 
 
298 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.42 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0478  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.81 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0492  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.34 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.37943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2402  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.44 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5849  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.03 
 
 
314 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1396  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.64 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1055  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.98 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148895  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3163  NAD dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.25 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
279 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345391  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4140  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.44 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000198546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1659  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.48 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.02 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1493  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.96 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2597  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.49 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249554  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2995  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.64 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737717  normal  0.385559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15930  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.32 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0515  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.36 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3036  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.92 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.09 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547009  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3679  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.94 
 
 
285 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0953  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.35 
 
 
281 aa  87  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.51 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.682696  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5899  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.83 
 
 
321 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>