More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0850 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0850  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 
314 aa  613  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1967  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.56 
 
 
308 aa  122  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2554  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.41 
 
 
292 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02230  conserved hypothetical protein  29.72 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0219255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3653  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.83 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2525  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.96 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.04 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0589  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.94 
 
 
285 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0766528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1084  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.01 
 
 
283 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0125965  normal  0.0422522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.12 
 
 
294 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0091  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.04 
 
 
294 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1255  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.54 
 
 
293 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.463201  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0094  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.04 
 
 
294 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.08 
 
 
278 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.87 
 
 
293 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2549  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.7 
 
 
292 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4601  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.52 
 
 
282 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.33 
 
 
298 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4291  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.6 
 
 
298 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1563  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.95 
 
 
295 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25531 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.81 
 
 
285 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3163  NAD dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 
306 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3106  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.82 
 
 
278 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2324  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.42 
 
 
297 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1313  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.64 
 
 
276 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6045  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.53 
 
 
333 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.351702 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4174  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.83 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3226  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.85 
 
 
300 aa  99.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1385  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.71 
 
 
306 aa  99  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.18 
 
 
286 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0588  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.64 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.74 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.466634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0424  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.33 
 
 
306 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6598  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.97 
 
 
321 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456488 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1684  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.62 
 
 
307 aa  95.5  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1472  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.45 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.29 
 
 
281 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217368  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0306  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.97 
 
 
283 aa  94  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3287  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.05 
 
 
290 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2761  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.2 
 
 
300 aa  94  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.015422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3011  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.44 
 
 
303 aa  93.2  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.289187  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5752  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.83 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6116  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.83 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2856  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.14 
 
 
285 aa  92.4  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0978379  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2011  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.62 
 
 
306 aa  92.4  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.73104  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1216  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.92 
 
 
296 aa  92.4  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1849  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.19 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1987  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.19 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.298585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0633  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.56 
 
 
285 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3161  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.19 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3138  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.19 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3073  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.43 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.419885  normal  0.223963 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.19 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.648402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0478  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.75 
 
 
296 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2756  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.19 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181808  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0492  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.75 
 
 
296 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.37943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.16 
 
 
286 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3709  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.46 
 
 
309 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0926  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.19 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.34 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.10972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1504  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.9 
 
 
369 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4945  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.48 
 
 
286 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489214 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1750  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.07 
 
 
283 aa  90.9  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.963734 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3531  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.83 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.4 
 
 
281 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1487  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.68 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000030027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0328  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.31 
 
 
278 aa  89.4  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.35 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4188  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.63 
 
 
291 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.46 
 
 
279 aa  89  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345391  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1727  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.03 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2828  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.86 
 
 
291 aa  89  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.39163  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6087  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.58 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25518  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1426  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.04 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.41063  hitchhiker  0.00349813 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0509  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.73 
 
 
301 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.71 
 
 
281 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1209  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.4 
 
 
284 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.85 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.0356517 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0776  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.33 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0494  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.28 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0823  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  25.5 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2402  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.18 
 
 
286 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1969  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.17 
 
 
306 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1420  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.09 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.41 
 
 
305 aa  87  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2138  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.4 
 
 
296 aa  87  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5849  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.93 
 
 
314 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1724  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.64 
 
 
296 aa  87  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00037704  normal  0.832838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1396  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.64 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.33 
 
 
293 aa  87  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128844  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1437  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.87 
 
 
363 aa  86.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2661  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.03 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4815  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.63 
 
 
299 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0635  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.21 
 
 
295 aa  86.3  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2507  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.41 
 
 
272 aa  85.5  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0697  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.42 
 
 
299 aa  85.9  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0840  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.8 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.774562  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7602  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.34 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1445  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0106  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.54 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>