More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0060 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 
281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0481  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  51.23 
 
 
294 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0599  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  51.23 
 
 
294 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1338  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.25 
 
 
284 aa  272  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.326275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1125  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.25 
 
 
284 aa  271  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.110653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1138  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.62 
 
 
284 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.62 
 
 
284 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1376  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.62 
 
 
284 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1118  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.62 
 
 
284 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000464599  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1112  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.99 
 
 
284 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0345479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1299  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.25 
 
 
284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0940  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  46.32 
 
 
283 aa  258  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.01 
 
 
285 aa  256  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4140  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  45.96 
 
 
287 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000198546 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0953  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  45.71 
 
 
281 aa  255  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1270  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  50.21 
 
 
246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  51.97 
 
 
237 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2097  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.84 
 
 
280 aa  251  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2365  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  44.32 
 
 
280 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2472  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.59 
 
 
280 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3272  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.53 
 
 
276 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.86 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1659  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.81 
 
 
277 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3106  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.29 
 
 
278 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3036  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.22 
 
 
283 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  44.36 
 
 
461 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.00000000841547 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3679  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.76 
 
 
285 aa  232  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2525  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.44 
 
 
298 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3345  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  44.13 
 
 
278 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0900  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.77 
 
 
278 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34862e-32 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2048  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.25 
 
 
300 aa  226  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1006  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.79 
 
 
299 aa  226  4e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.530196  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13108  putative dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.79 
 
 
288 aa  225  5.0000000000000005e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1724  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.11 
 
 
296 aa  224  8e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00037704  normal  0.832838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4467  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.53 
 
 
287 aa  224  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.39 
 
 
281 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547009  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0328  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.03 
 
 
278 aa  222  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.52 
 
 
286 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2661  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.05 
 
 
291 aa  222  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1779  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.21 
 
 
297 aa  221  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00243798  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1207  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.97 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2594  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.14 
 
 
314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3073  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.88 
 
 
282 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.419885  normal  0.223963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1487  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.01 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000030027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1996  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.01 
 
 
290 aa  215  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2262  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.01 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.99 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3135  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.78 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1699  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.21 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0285308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0478  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.28 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1054  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.48 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5899  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.4 
 
 
321 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0515  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.6 
 
 
291 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0492  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.28 
 
 
296 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.37943 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1444  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  40.57 
 
 
283 aa  211  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4945  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.92 
 
 
286 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489214 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.14 
 
 
281 aa  209  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.78 
 
 
293 aa  209  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2292  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.73 
 
 
292 aa  209  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1209  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40 
 
 
284 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0306  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.73 
 
 
283 aa  209  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.65 
 
 
293 aa  209  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128844  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0418  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.01 
 
 
288 aa  209  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1891  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.65 
 
 
286 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.657644  hitchhiker  0.00910437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2828  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.7 
 
 
291 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.39163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1509  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.43 
 
 
287 aa  208  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0232  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.65 
 
 
270 aa  208  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488037  normal  0.41258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3463  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.44 
 
 
294 aa  208  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.75 
 
 
298 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.466634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.41 
 
 
291 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1420  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.97 
 
 
279 aa  207  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.13 
 
 
296 aa  205  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1424  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.71 
 
 
284 aa  204  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000208207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0845  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.01 
 
 
294 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4210  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.36 
 
 
302 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1403  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.27 
 
 
288 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0633  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.79 
 
 
285 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.33 
 
 
261 aa  201  8e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1561  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.15 
 
 
285 aa  201  9e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0392  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.65 
 
 
299 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0874  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.65 
 
 
299 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4296  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.23 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.73519  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1445  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.07 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1133  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.22 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.853451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3993  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.46 
 
 
292 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.08 
 
 
285 aa  199  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3972  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.59 
 
 
294 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.379333 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0254  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.93 
 
 
283 aa  198  7e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3020  dTDP-6-deoxy-l-mannose-dehydrogenase  38.6 
 
 
293 aa  198  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.361116  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2888  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.89 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.124362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3917  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.82 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0252378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0764  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.81 
 
 
299 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.95 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.682696  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0045  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.32 
 
 
288 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0187  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.85 
 
 
270 aa  196  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2316  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.69 
 
 
297 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0781595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2011  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.49 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.73104  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8192  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.55 
 
 
301 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3501  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.23 
 
 
299 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.42914 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1750  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.26 
 
 
283 aa  193  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.963734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>