More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3653 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3653  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  100 
 
 
294 aa  607  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1563  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  65.07 
 
 
295 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0094  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  63.54 
 
 
294 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0091  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  62.85 
 
 
294 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2554  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  59.93 
 
 
292 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  51.39 
 
 
294 aa  325  7e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1967  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.79 
 
 
308 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1255  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.21 
 
 
293 aa  136  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.463201  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1426  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.65 
 
 
288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.41063  hitchhiker  0.00349813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3226  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.87 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0328  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.51 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2324  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.31 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.780097 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2507  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.43 
 
 
272 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.32 
 
 
305 aa  122  7e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0477  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.87 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.0000000000065602  decreased coverage  0.00000000361225 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1216  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.84 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5752  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.38 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6116  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.38 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1084  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.93 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0125965  normal  0.0422522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4815  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.67 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4601  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.33 
 
 
282 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2145  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.28 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.292783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0509  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.33 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6598  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.69 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0494  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.4 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.01 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.10972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0551  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.12 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6045  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.99 
 
 
333 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.351702 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1313  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.91 
 
 
276 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0452  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.7 
 
 
304 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0436  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.72 
 
 
304 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3878  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.7 
 
 
304 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0462  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.53 
 
 
304 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.64 
 
 
281 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217368  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3709  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.33 
 
 
309 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3053  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.26 
 
 
307 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0850  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.63 
 
 
314 aa  105  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7602  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.3 
 
 
314 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
286 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3163  NAD dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
306 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6087  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.01 
 
 
317 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25518  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0424  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.5 
 
 
306 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1385  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.31 
 
 
306 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0588  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.62 
 
 
327 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0589  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.58 
 
 
285 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0766528  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5849  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.47 
 
 
314 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4174  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.44 
 
 
306 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4291  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.12 
 
 
298 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.1 
 
 
285 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0823  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  24.92 
 
 
294 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3414  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.42 
 
 
303 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08032  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02240)  25.43 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.019625  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1537  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.74 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194378  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0794  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  25.59 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1621  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.27 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3531  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.41 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1055  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.52 
 
 
301 aa  96.3  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148895  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4140  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.22 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000198546 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.8 
 
 
278 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2763  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.33 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1659  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.71 
 
 
277 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.2 
 
 
286 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2262  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.5 
 
 
294 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.71 
 
 
473 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1969  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.26 
 
 
306 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0481  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.11 
 
 
294 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0599  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.11 
 
 
294 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4428  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.56 
 
 
298 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.28 
 
 
285 aa  92.4  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1998  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.99 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000898814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4446  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.71 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0232  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.82 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488037  normal  0.41258 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2856  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.08 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0978379  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1531  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.158917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
279 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345391  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0633  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.24 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0953  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.02 
 
 
281 aa  89.7  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3679  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.5 
 
 
285 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.99 
 
 
723 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.08 
 
 
281 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.94 
 
 
296 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02230  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0219255  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0187  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.21 
 
 
738 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4467  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.21 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2402  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.6 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0122  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.49 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0110  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.88 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2594  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.15 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2597  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.52 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.64 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0254  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.82 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.55 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.5 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.682696  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2888  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.78 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.124362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4210  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.66 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0637  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.67 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.618272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2712  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.08 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.91 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1493  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.24 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>