148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1615 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1714  Radical SAM domain protein  97.63 
 
 		 464 aa  940    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.540627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2894  radical SAM domain-containing protein  71.55 
 
 		 462 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00476691  normal  0.460921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1615  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 464 aa  966    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2251  radical SAM domain-containing protein  47.77 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.677683 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 		 484 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0737  radical SAM domain-containing protein  33.48 
 
 		 480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 		 487 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  29.7 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  22.71 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  23.22 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  22.47 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 447 aa  57  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  22.28 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  22.94 
 
 		 476 aa  57  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  21.69 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  28.28 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 383 aa  53.5  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 		 485 aa  53.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  22.69 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  22.69 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  21.69 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 		 327 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  25.11 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  29.87 
 
 		 344 aa  50.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 460 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 454 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 368 aa  50.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 462 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  20.66 
 
 		 394 aa  50.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  28.12 
 
 		 481 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  27.33 
 
 		 387 aa  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 453 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  21.84 
 
 		 447 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.97 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  24.53 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0865  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  23.72 
 
 		 489 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  20.91 
 
 		 462 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  20.66 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  25.69 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2446  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  23.58 
 
 		 336 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  23.66 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  25.91 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 345 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  20.3 
 
 		 394 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25.11 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  24.09 
 
 		 380 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 375 aa  47.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 		 468 aa  47.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  21.45 
 
 		 457 aa  47.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1745  oxidoreductase  22.65 
 
 		 372 aa  47.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3252  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  23.68 
 
 		 386 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  23.83 
 
 		 399 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2244  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 371 aa  47  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5307  radical SAM family protein  24.12 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5553  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  20.3 
 
 		 394 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1963  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  27.71 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1287  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 332 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0981  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1268  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  21.98 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3055  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2930  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2243  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  27.47 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  22.66 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  22.66 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0969  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  27.42 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>