165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 268 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  90.26 
 
 		 267 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  65.79 
 
 		 266 aa  332  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  62.84 
 
 		 263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  63.6 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  63.46 
 
 		 260 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  64.09 
 
 		 254 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  57.75 
 
 		 272 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  57.81 
 
 		 272 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  58.43 
 
 		 268 aa  285  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  38.65 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  35.32 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  39.01 
 
 		 243 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  36.52 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  32.03 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  28.8 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  35.71 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  29.8 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  31.48 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  30.68 
 
 		 339 aa  92  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  31.76 
 
 		 349 aa  92  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  33.52 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  27.94 
 
 		 338 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  29.15 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  28 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  27.57 
 
 		 338 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  27.57 
 
 		 338 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  28.19 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  27.36 
 
 		 334 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  27.57 
 
 		 338 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.07 
 
 		 260 aa  85.9  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  30.36 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  30.22 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  30.54 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  26.4 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  23.67 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  24.63 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  27.16 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  24.29 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  27.54 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  27.93 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  27.33 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  25.83 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  29.7 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  25.83 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  31.58 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  26.86 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  26.71 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  29.45 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  25.75 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  24.11 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  29.94 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  27.39 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  27.93 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  28.83 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  30.41 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  26.32 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  28.98 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  23.64 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  34.27 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3563  flagellar assembly protein FliH  22.08 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  23.31 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  24.89 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  25.75 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  22.16 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  26.63 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  26.22 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  26.22 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  29.06 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  23.35 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  27.93 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0220  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.43 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  27.89 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  29.07 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  26.59 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  26.58 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  27.41 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  33.52 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  27.56 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  27.78 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  25.63 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  25.63 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  24.66 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  24.66 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  24.66 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  28.49 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  30.67 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  25.95 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  28.49 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.25 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  29.71 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.84 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  23.08 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  25 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  25 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  25 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>