134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_36540 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  524  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  96.51 
 
 
258 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  75 
 
 
252 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  65.08 
 
 
256 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  66.53 
 
 
248 aa  338  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  63.89 
 
 
256 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  63.49 
 
 
256 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  63.1 
 
 
270 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  63.86 
 
 
256 aa  325  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  58.06 
 
 
259 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  58.06 
 
 
259 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  57.6 
 
 
260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  56.49 
 
 
244 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  55.42 
 
 
259 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  55.2 
 
 
267 aa  278  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6153  hypothetical protein  55.28 
 
 
271 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  52.24 
 
 
276 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  51.91 
 
 
242 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.46 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.14 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  26.46 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  27.07 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  22.91 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.09 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  27.27 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  30.3 
 
 
876 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  27.75 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  34.26 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  33.59 
 
 
868 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  31.69 
 
 
300 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  23.11 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  28.12 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  24.57 
 
 
273 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  30.77 
 
 
1010 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  34.69 
 
 
321 aa  49.3  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
285 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.36 
 
 
622 aa  48.9  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  24.64 
 
 
264 aa  48.9  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  33.64 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  30.77 
 
 
298 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  32.73 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  33.65 
 
 
498 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  34.26 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  31.44 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.46 
 
 
652 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  31.4 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  30.77 
 
 
968 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  29.6 
 
 
866 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  28.24 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  26.98 
 
 
218 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  34.02 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.92 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  22.35 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3439  hypothetical protein  33.63 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  30.77 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  27.48 
 
 
275 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
274 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  28.32 
 
 
467 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  32.41 
 
 
733 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  25.98 
 
 
310 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  35.96 
 
 
318 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  29.68 
 
 
451 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  32.32 
 
 
501 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  33.64 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  35.71 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  37.88 
 
 
265 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
313 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
313 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
313 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  36.47 
 
 
976 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.96 
 
 
677 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  34.33 
 
 
286 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  33.01 
 
 
365 aa  45.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  23.5 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1155  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.230861  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  32.5 
 
 
474 aa  45.4  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  27.41 
 
 
678 aa  45.4  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  31.19 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  24.43 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  32.74 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  31.3 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.94 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  31.52 
 
 
897 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  32.58 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  32.58 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  36.56 
 
 
363 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  24.68 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  22.71 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  34.58 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  32.69 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.25 
 
 
653 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  29.75 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  21.26 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  30.4 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.89 
 
 
597 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  32.06 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  26.61 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>