More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20970 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  100 
 
 
418 aa  840    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  47.72 
 
 
408 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  45.54 
 
 
412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  43.81 
 
 
426 aa  302  9e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  44.63 
 
 
405 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  45.71 
 
 
400 aa  285  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  41.3 
 
 
411 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  44.76 
 
 
423 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  40.98 
 
 
417 aa  276  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  39.95 
 
 
420 aa  276  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  42.09 
 
 
411 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  43.09 
 
 
398 aa  269  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  41.76 
 
 
402 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  44.13 
 
 
406 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  39.78 
 
 
410 aa  256  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  41.71 
 
 
412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  41.29 
 
 
420 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  35.99 
 
 
411 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  37.36 
 
 
411 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  35.99 
 
 
411 aa  249  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  36.24 
 
 
411 aa  249  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  43.63 
 
 
400 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  42.4 
 
 
401 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  36.26 
 
 
411 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  36.26 
 
 
411 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  36.26 
 
 
411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  35.71 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  41.23 
 
 
402 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  35.71 
 
 
411 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  35.71 
 
 
411 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  35.71 
 
 
411 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  41.92 
 
 
394 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  41.16 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  42.86 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  37.67 
 
 
396 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  40.66 
 
 
419 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  38.89 
 
 
414 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  40.66 
 
 
399 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  35.25 
 
 
407 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  38.61 
 
 
388 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  38.66 
 
 
422 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  41.36 
 
 
411 aa  225  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  39.77 
 
 
390 aa  225  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  39.34 
 
 
398 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  43.26 
 
 
399 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  36.8 
 
 
414 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  38.42 
 
 
407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  37.61 
 
 
407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  38.42 
 
 
407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  39.71 
 
 
395 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  40.05 
 
 
421 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  39.89 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  39.89 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  39.89 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  40.43 
 
 
412 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  38.67 
 
 
373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  38.42 
 
 
421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  39.34 
 
 
398 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  42 
 
 
401 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  37.3 
 
 
417 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  43.3 
 
 
417 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  42.34 
 
 
399 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  43.15 
 
 
400 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  42.81 
 
 
400 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  41.26 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.81 
 
 
395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  37.22 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  35.69 
 
 
409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  35.59 
 
 
407 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  43.73 
 
 
367 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  38.07 
 
 
408 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  35.34 
 
 
407 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  35.34 
 
 
407 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  38.27 
 
 
400 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  38.19 
 
 
399 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  37.22 
 
 
401 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  40.55 
 
 
404 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  38.26 
 
 
421 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  38 
 
 
408 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  39.83 
 
 
366 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  38.14 
 
 
357 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.78 
 
 
380 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  36.94 
 
 
402 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  39.03 
 
 
400 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  41.16 
 
 
431 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  38.17 
 
 
402 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  36.04 
 
 
406 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  40.16 
 
 
399 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  39.52 
 
 
444 aa  206  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  40 
 
 
459 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  38.26 
 
 
417 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  41.12 
 
 
402 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  39.41 
 
 
408 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  39.1 
 
 
399 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  35.81 
 
 
411 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  40.66 
 
 
447 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  41.07 
 
 
409 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  37.82 
 
 
432 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  37.75 
 
 
417 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  37.47 
 
 
409 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>