137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4372 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  100 
 
 		 299 aa  562  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  37.24 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  36.9 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  38.95 
 
 		 298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  39.5 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  39.5 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  40.68 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  37.81 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  38.65 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  38.7 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.58 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.93 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  38.87 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  38.27 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  38.65 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  39.01 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.31 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  34.96 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  39.48 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  35.42 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.71 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 294 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  38.77 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  36.4 
 
 		 640 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  38.04 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 289 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.01 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  31.34 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  30.4 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  32.18 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  32.97 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  27.43 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 329 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  32.97 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  32.84 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  26.44 
 
 		 365 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.43 
 
 		 584 aa  98.2  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  32.16 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  41.3 
 
 		 120 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 410 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.08 
 
 		 352 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  25.93 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  29.13 
 
 		 425 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  26.02 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  29.52 
 
 		 417 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  26.17 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  27.35 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1565  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  36 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0406  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 361 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3930  monosaccharide-transporting ATPase  32.81 
 
 		 360 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 353 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  29.73 
 
 		 291 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3886  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2904  Monosaccharide-transporting ATPase  37.38 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0339421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 462 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  27.21 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>