203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2829 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  100 
 
 
309 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  55.3 
 
 
307 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  53.31 
 
 
306 aa  293  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  53.41 
 
 
304 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  51.54 
 
 
325 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  49.67 
 
 
305 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  53.1 
 
 
330 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  52.94 
 
 
329 aa  261  8e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  50.34 
 
 
315 aa  258  9e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  46.15 
 
 
313 aa  257  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  50 
 
 
295 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  48.07 
 
 
300 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  49.32 
 
 
330 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  52.38 
 
 
302 aa  239  4e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.3 
 
 
299 aa  239  4e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  45.55 
 
 
299 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.82 
 
 
297 aa  234  9e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  45.04 
 
 
293 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  41.61 
 
 
298 aa  226  4e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  45.33 
 
 
298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  46.77 
 
 
299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  44.67 
 
 
298 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  47.12 
 
 
313 aa  222  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  44.37 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  44.37 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  44.37 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.08 
 
 
289 aa  219  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  44.37 
 
 
298 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  45.58 
 
 
295 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  43.58 
 
 
298 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  45.58 
 
 
295 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.45 
 
 
294 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  44.26 
 
 
312 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  44.11 
 
 
640 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  42.05 
 
 
303 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.8 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.74 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  43.4 
 
 
302 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  46.45 
 
 
294 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  43.06 
 
 
302 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  44.56 
 
 
317 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  39.93 
 
 
305 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  46.79 
 
 
287 aa  209  6e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  44.56 
 
 
311 aa  208  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  45.71 
 
 
292 aa  208  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  43.01 
 
 
299 aa  208  9e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  44 
 
 
339 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  40.27 
 
 
305 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  46.29 
 
 
296 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  43.49 
 
 
294 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  43.75 
 
 
303 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  44.64 
 
 
292 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  41.96 
 
 
299 aa  205  9e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  42.67 
 
 
336 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  46.1 
 
 
292 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 
298 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  46.29 
 
 
296 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 
298 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 
298 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 
298 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 
298 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 
298 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  44.56 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  44.14 
 
 
296 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  42.38 
 
 
327 aa  199  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  42.31 
 
 
299 aa  198  9e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  38.87 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  41.72 
 
 
297 aa  196  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  42.28 
 
 
289 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  42.7 
 
 
294 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  37.32 
 
 
365 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  46.35 
 
 
584 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  40.43 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  38.55 
 
 
299 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
300 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  35.69 
 
 
363 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  32.28 
 
 
329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  35.66 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  53.33 
 
 
120 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  28.44 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  27.45 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  27.45 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  29.65 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  26.96 
 
 
311 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  26.96 
 
 
311 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  26.96 
 
 
311 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  26.96 
 
 
311 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  26.96 
 
 
311 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  26.96 
 
 
311 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  23.64 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  26.96 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  27.83 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  27.97 
 
 
339 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  26.61 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2828  inner-membrane translocator  36.13 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1363  inner-membrane translocator  26.4 
 
 
332 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  29.92 
 
 
341 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  27.39 
 
 
351 aa  53.5  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  30.56 
 
 
325 aa  53.1  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>