108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2105 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  100 
 
 		 312 aa  587  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  67.57 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  64.19 
 
 		 298 aa  362  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  63.18 
 
 		 298 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  63.51 
 
 		 298 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  63.51 
 
 		 298 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  63.51 
 
 		 298 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  63.92 
 
 		 313 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  63.51 
 
 		 298 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  64.26 
 
 		 339 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  62.5 
 
 		 298 aa  338  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  60.4 
 
 		 302 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  60.19 
 
 		 302 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  63.23 
 
 		 298 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  63.23 
 
 		 298 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  63.23 
 
 		 298 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  63.23 
 
 		 298 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  63.23 
 
 		 298 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  63.23 
 
 		 298 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  63.23 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  62.54 
 
 		 296 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  59.68 
 
 		 303 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  62.54 
 
 		 296 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  61.17 
 
 		 295 aa  328  8e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  61.17 
 
 		 295 aa  328  9e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  62.54 
 
 		 293 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  62.76 
 
 		 296 aa  318  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  56.38 
 
 		 299 aa  318  7.999999999999999e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  60 
 
 		 294 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  56.33 
 
 		 299 aa  306  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  56.67 
 
 		 299 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  62.5 
 
 		 292 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  60.21 
 
 		 294 aa  298  9e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  59.52 
 
 		 294 aa  295  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  59.52 
 
 		 294 aa  292  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  61.46 
 
 		 292 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  60.07 
 
 		 292 aa  292  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  55.33 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  59.17 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  54.18 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  55.41 
 
 		 317 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  56.08 
 
 		 311 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  55.22 
 
 		 327 aa  275  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  53.72 
 
 		 295 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  47.84 
 
 		 306 aa  251  8.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  52.07 
 
 		 329 aa  238  9e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  48.81 
 
 		 297 aa  236  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  43.43 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  48.12 
 
 		 304 aa  235  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  47.44 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  49.31 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  47.46 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  43.92 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  46.08 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  47.68 
 
 		 330 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  47.68 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  46.24 
 
 		 640 aa  202  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.8 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.84 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.36 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  43.21 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  44.49 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 		 298 aa  188  9e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  38.49 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.31 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  37.83 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  38.91 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  41.63 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.27 
 
 		 584 aa  153  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  59.18 
 
 		 120 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1189  inner-membrane translocator  24.5 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.227031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 354 aa  49.7  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  28 
 
 		 324 aa  49.3  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4828  ABC transporter  26.4 
 
 		 707 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  28.09 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  28.14 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  28.14 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0371  inner-membrane translocator  26.5 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  27.05 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  27.64 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  27.64 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  28.14 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  24.22 
 
 		 391 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  25 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  36 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  27.64 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  28.57 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>