236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1570 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  100 
 
 
307 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  55.3 
 
 
309 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  56.68 
 
 
306 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  55.63 
 
 
302 aa  279  5e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  51.7 
 
 
315 aa  275  6e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  47.65 
 
 
305 aa  269  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  50.64 
 
 
325 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  49.83 
 
 
304 aa  265  8e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  53.45 
 
 
295 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  52.86 
 
 
330 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  49.65 
 
 
300 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  51.87 
 
 
329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  50.34 
 
 
330 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  46.55 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  46.18 
 
 
298 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  46.18 
 
 
298 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  46.18 
 
 
298 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  45.07 
 
 
303 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  47.04 
 
 
298 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  45.99 
 
 
298 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  44.09 
 
 
293 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  45.18 
 
 
313 aa  229  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  45.64 
 
 
298 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.71 
 
 
297 aa  229  6e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  46.18 
 
 
298 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  47.02 
 
 
302 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  46.67 
 
 
302 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  46.34 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  46.49 
 
 
313 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.86 
 
 
294 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  46.94 
 
 
336 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  43 
 
 
299 aa  221  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  46.94 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  48.08 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  46.94 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  46.94 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  46.94 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  46.94 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  48.08 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  46.94 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.17 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  46.6 
 
 
339 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  44.83 
 
 
294 aa  218  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  40.56 
 
 
298 aa  217  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  43.33 
 
 
299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  46.6 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  45.61 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  49.13 
 
 
293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  44.57 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.93 
 
 
308 aa  209  4e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  44.64 
 
 
292 aa  208  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  47.28 
 
 
296 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  42.58 
 
 
311 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  42.37 
 
 
299 aa  206  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  44.15 
 
 
294 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  44.24 
 
 
303 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  42.03 
 
 
299 aa  203  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  45.14 
 
 
292 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  47.28 
 
 
296 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  45.83 
 
 
292 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  41.88 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.32 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  43.06 
 
 
640 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  42.9 
 
 
327 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  43.79 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
287 aa  198  9e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  37.72 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  42.24 
 
 
299 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  40.56 
 
 
297 aa  189  5e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  44.22 
 
 
300 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  36.98 
 
 
306 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  38.01 
 
 
289 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  35.87 
 
 
305 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  34.74 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.46 
 
 
584 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  34.19 
 
 
329 aa  165  9e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  73.39 
 
 
120 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  35.63 
 
 
363 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  36.46 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  25.08 
 
 
341 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  25.89 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  23.19 
 
 
310 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  26.6 
 
 
351 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  25.89 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  26.6 
 
 
351 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  26.41 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  26.6 
 
 
351 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  27.6 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  24.32 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  28.79 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  24.71 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  25.66 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  28.29 
 
 
342 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  28.49 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  26.69 
 
 
313 aa  53.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  26.82 
 
 
314 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  27.08 
 
 
348 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  26.82 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  25.66 
 
 
345 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  25.66 
 
 
345 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>